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生物系教师简介 —— 霍毅欣 教授 / 博士生导师

来源:    编辑:生命学院   审核:周连景   发布日期:2018-09-04


霍毅欣

北京理工大学教授、博士生导师

生命学院副院长、生物技术专业责任教授

国家高层次青年人才、中国生物工程学会理事

邮箱:huoyixin@bit.edu.cn      电话:18910254522


教育经历

2008-08至2011-07,加州大学洛杉矶分校,博士后,导师:James C. Liao教授(美国科学院院士、美国工程院院士、美国国家发明家科学院院士,第三世界科学院院士、台湾中央研究院院士、现任台湾中央研究院院长)

2006-05至2008-08,加州大学洛杉矶分校,博士后,导师:Jay D. Gralla教授

2002-09至2005-12,巴黎第七大学,分子微生物学及病毒学,博士(联合培养、分别获得中法两国博士学位),导师:Annie Kolb研究员

2000-09至2005-12,北京大学,生物化学及分子生物学,博士,导师:王忆平教授

1995-09至1999-06,南开大学,微生物学,学士

科研与学术工作经历

2021-01至今,北京理工大学,生命学院,长聘教授

2019-10至今,北京理工大学,生命学院,副院长(分管研究生、学科)

2019-09至今,北京理工大学,生命学院,生物技术专业责任教授

2019-01至今,北京理工大学,工业和信息化部“分子医学与生物诊疗”重点实验室,副主任

2017-09至2020-12,北京理工大学,生命学院,生物工程专业责任教授

2015-09至2020-12,北京理工大学,生命学院,教授

2014-11至2015-09,加州大学洛杉矶分校苏州先进技术研究院,生物能源研究中心,实验室主任(兼)

2011-08至2015-09,Nantworks集团Easel生物技术公司,项目主管、资深研究员

研究方向

碳中和(代表性文章见下[52],[10],[8])

       二氧化碳的资源化,以固碳微生物实现二氧化碳的高值转化

基因编辑(代表性文章见下[50],[46],[34])

       原核、真核细胞的基因编辑、高鲁棒性的底盘宿主构建;方法学开发

代谢工程(代表性文章见下[59],[56],[43])

       大宗化学品、药物中间体的微生物合成途径构建及高效生产

酶工程(代表性文章见下[65],[35])

       塑料降解酶;生物传感器的研发

生物信息学(代表性文章见下[59],[49])

       植物功能基因挖掘;微生物进化机制

主持科研项目及获奖

(一)入职北理工后

1、科学技术部国家重点研发计划,合成生物学专项,2019YFA0904104,非天然氨基酸生物合成及其适配底盘的设计及应用,2020/01-2024/12,536万元,在研,主持(课题负责人,为项目2019YFA0904100的课题四)

2、科学技术部国家重点研发计划,绿色生物制造专项,2021YFC2100500,高效微生物细胞工厂的设计原理与构建方法,2021/07-2024/06,在研,子课题负责人

3、国家自然科学基金委员会国际合作项目,31961133014,塑料解聚及资源化微生物菌群的人工构建,2020/01-2023/12,在研,参加

4、济南市“高校20条”资助项目,发酵废弃物的微生物高值转化,2019/12-2021/12,已结题,主持

5、北京理工大学科技创新计划,二氧化碳的微生物固定,2019/01-2021/12,已结题,主持

6、国家自然科学基金委员会重点项目,21736002,微生物合成萜烯化合物过程中的跨膜转运与代谢传质强化,2018/01-2022/12,在研,参加

7、科学技术部国家重点研发计划,2017YFD0201400,天然绿色生物农药的合成生物学与组合合成技术,2017/01-2021/06,已结题,子课题负责人

8、国家自然科学基金委员会,面上项目,21676026,α-香树酯醇的酶法异构机理及其微生物合成,2017/01-2020/12,已结题,主持

9、江苏省双创人才,2016/01-2018/12,已结题,主持

10、国家海外高层次人才引进计划青年项目,2016/07-2018/06,已结题,主持

11、北京理工大学优秀青年教师资助计划,利用微生物实现二氧化碳的资源化, 2016/07-2018/06,已结题,主持

(二)入职北理工前

1.Bio-Oxo Technologies, Awarded by Department of Energy (DOE), No. DE-EE0005773, 2014/12-2016/12, Total: 2.5 millions US dollars, 主持

2.Electro-Autotrophic Synthesis of Higher Alcohols, Awarded by Department of Energy (DOE), No. AR0000085, PI: James Liao (UCLA), Year 2010-2014, Total: 4 million US dollars, Co-PI(共同主持)

3.NIH Research Grant 5 R01 GM035754:2, 参与

4.NIH Research Grant 5 R01 GM049048:11, 参与

5.Internal Fund for UCLA-Department of Energy Institute for Genomics and Proteomics (DOE, 2008-2011), 参与

6.Sino - French Advanced Research Program (PRA) (2002-2005), 参与

7.China–Ireland Science and Technology Collaboration Research Fund (2002-2005),参与

8.Finalist of Chancellor’s Postdoctoral Award, UCLA (2011)

9.GuangHua Doctoral candidate Award, Peking University (2004)

10.French governmental CNOUS Fellowship Award (2002-2005)

11.Honorable Award for undergraduate students in Biology, Nankai University (1996)

代表作(10篇)

[65] Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Using genome and transcriptome analysis to elucidate biosynthetic pathways[J]. Curr Opin Biotechnol. 2022, 75: 102708.(影响因子9.74,发表年月2022-06)

[56] Tong Wu#, Zhenya Chen#, Shuyuan Guo, Cuiying Zhang, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR mutants for constructing multifunctional alcohol biosensors. ACS Synth Biol. 2021(影响因子5.11,发表年月2022-02)

[52] Xiaoyan Ma#, Lianjie Ma#, Yi-Xin Huo*. Reconstructing the transcription regulatory network to optimize resource allocation for robust biosynthesis. Trends Biotechnol. 2021(影响因子19.526,发表年月2021-11)

[51] 马晓焉,王雪芹,马炼杰,霍毅欣*。高级醇的微生物绿色制造。生物工程学报。2021. 37(05): 1721-36(影响因子0.977,发表年月2021-05)

[35] Huan Yu#, Zhenya Chen#, Ning Wang, Shengzhu Yu, Yajun Yan, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR for screening butanol overproducers. Metab Eng. 2019. 56: 28-38(影响因子9.783,发表年月2019-12)

[34] Chaoyong Huang, Tingting Ding, Jingge Wang, Xueqin Wang, Liwei Guo, Jialei Wang, Lin Zhu, Changhao Bi, Xueli Zhang, Xiaoyan Ma, Yi-Xin Huo*. CRISPR-Cas9-assisted native end-joining editing offers a simple strategy for efficient genetic engineering in Escherichia coli. Appl Microbiol Biotechnol. 2019. 103(20): 8497-509(影响因子4.813,发表年月2019-10)

[24] Bo Zheng#, Xiaoyan Ma#, Ning Wang, Tingting Ding, Liwei Guo, Xiaorong Zhang, Yu Yang, Chun Li, Yi-Xin Huo*. Utilization of rare codon-rich markers for screening amino acid overproducers. Nat Commun. 2018. 9(1): 1-11(影响因子14.919,发表年月2018-09)

[11] Yi-Xin Huo, David G Wernick, James C Liao*. Toward nitrogen neutral biofuel production. Curr Opin Biotechnol. 2012. 23(3): 406-13(影响因子9.74,发表年月2012-06)

[10] Han Li, Paul H Opgenorth, David G Wernick, Steve Rogers, Tung-Yun Wu, Wendy Higashide, Peter Malati, Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, James C Liao*. Integrated electromicrobial conversion of CO2 to higher alcohols. Science. 2012. 335(6076): 1596(影响因子47.728,发表年月2012-05)

[8] Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, Jimmy G Lafontaine Rivera, Emma Monte, Claire R Shen, Yajun Yan, James C Liao*. Conversion of proteins into biofuels by engineering nitrogen flux. Nat Biotechnol. 2011. 29(4): 346-51(影响因子54.908,发表年月2011-05)

总文章列表

[65] Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Using genome and transcriptome analysis to elucidate biosynthetic pathways[J]. Curr Opin Biotechnol. 2022, 75: 102708.(影响因子9.74,发表年月2022-06)

[64] Tong Wu, Yumei Liu, Jinsheng Liu, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo*. Metabolic engineering and regulation of diol biosynthesis from renewable biomass in Escherichia coli[J]. Biomolecules. 2022, 12:715.(影响因子4.694,发表年月2022-06)

[63] 刘玉美,毋彤,陈振娅,霍毅欣*。非天然氨基酸及非天然蛋白合成的研究进展[J]。生物加工过程。2022,20(02):182-194. (影响因子1.109,发表年月2022-06)

[62] Zhenya Chen, Tongtong Chen, Shengzhu Yu, et al. A high-throughput visual screening method for p-hydroxybenzoate hydroxylase to increase phenolic compounds biosynthesis[J]. Biotechnol. Biofuels, 2022, 15(1): 1-15.(影响因子5.84,发表年月2022-05)

[61] Mengyuan Li, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. CRISPR-Mediated Base Editing: From Precise Point Mutation to Genome-Wide Engineering in Nonmodel Microbes[J]. Biology, 2022, 11(4): 571.(影响因子5.007,发表年月2022-04)

[60] Jiheng Tian, Baowen Xing, Mengyuan Li, Changgeng Xu, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. Efficient Large-Scale and Scarless Genome Engineering Enables the Construction and Screening of Bacillus subtilis Biofuel Overproducers[J]. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 4853.(影响因子5.923,发表年月2022-04)

[59] Yuhui Du, Wei Song, Zhiqiu Yin, Shengbo Wu, Jiaheng Liu, Ning Wang, Hua Jin, Jianjun Qiao, Yi-xin Huo*. Genomic Analysis Based on Chromosome-Level Genome Assembly Reveals an Expansion of Terpene Biosynthesis of Azadirachta indica. Front Plant Sci. 2022, 13: 853861. (影响因子5.753,发表年月2022-04)

[58] Hao Guo#, Huiyan Wang#, Tongtong Chen, Yi-Xin Huo*. Engineering critical amino acid residues of lanosterol synthase to improve the production of triterpenoids in Saccharomyces cerevisiae. ACS Synth Bio. 2022 (submitted)

[57] Liwei Guo, Lichao Sun*, Yi-xin Huo. Toward bioproduction of oxo chemicals from C1 feedstocks using isobutyraldehyde as an example, Biotechnology for Biofuels and Bioproducts. 2022 (under revision)

[56] Tong Wu#, Zhenya Chen#, Shuyuan Guo, Cuiying Zhang, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR mutants for constructing multifunctional alcohol biosensors[J]. ACS Synth Biol. 2022, 11(3): 1251-1260(影响因子5.11,发表年月2022-02)

[55] Shengzhu Yu, Bo Zheng, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo. Metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum for producing branched chain amino acids. Microb Cell Fact. 2021. 20(1): 1-14(影响因子5.328,发表年月2021-12)

[54] Luyao Zhao, Zhenya Chen, Sheng Lin, Tong Wu, Shengzhu Yu, Yi-Xin Huo*. In Vitro Biosynthesis of Isobutyraldehyde Through the Establishment of a One-Step Self-Assembly-Based Immobilization Strategy. J Agr Food Chem. 2021. 69(48): 14609-19(影响因子5.279,发表年月2021-11)

[53] Huiyan Wang#, Hao Guo#, Ning Wang*, Yi-Xin Huo*. Toward the Heterologous Biosynthesis of Plant Natural Products: Gene Discovery and Characterization. ACS Synth Biol. 2021(影响因子5.11,发表年月2021-11)

[52] Xiaoyan Ma#, Lianjie Ma#, Yi-Xin Huo*. Reconstructing the transcription regulatory network to optimize resource allocation for robust biosynthesis. Trends Biotechnol. 2021(影响因子19.526,发表年月2021-11)

[51] 马晓焉,王雪芹,马炼杰,霍毅欣*。高级醇的微生物绿色制造。生物工程学报。2021. 37(05): 1721-36(影响因子0.977,发表年月2021-05)

[50] Jingge Wang#, Chaoyong Huang#, Kai Guo, Lianjie Ma, Xiangyu Meng, Ning Wang*, Yi-Xin Huo*. Converting Escherichia coli MG1655 into a chemical overproducer through inactivating defense system against exogenous DNA. Syn Syst Biotechno. 2020. 5(4): 333-42(影响因子4.781,发表年月2020-12)

[49] Huiyan Wang, Ning Wang*, Yi-Xin Huo*. Multi-tissue transcriptome analysis using hybrid-sequencing reveals potential genes and biological pathways associated with azadirachtin A biosynthesis in neem (azadirachta indica). BMC Genomics. 2020. 21(1): 1-17(影响因子3.969,发表年月2020-10)

[48] Mengli Xia, Lin Hu, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Myroides albus sp. nov., isolated from the gut of plastic-eating larvae of the coleopteran insect Zophobas atratus. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(10): 5460-6(影响因子2.747,发表年月2020-09)

[47] Ziyu Xu, Mengli Xia, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Intestinirhabdus alba gen. nov., sp. nov., a novel genus of the family Enterobacteriaceae, isolated from the gut of plastic-eating larvae of the Coleoptera insect Zophobas atratus. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(9): 4951-9(影响因子2.747,发表年月2020-09)

[46] Chaoyong Huang#, Liwei Guo#, Jingge Wang, Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Efficient long fragment editing technique enables large-scale and scarless bacterial genome engineering. Appl Microbiol Biotechnol. 2020. 104(18): 7943-56(影响因子4.813,发表年月2020-08)

[45] Hao Guo, Huiyan Wang, Yi-Xin Huo*. Engineering critical enzymes and pathways for improved triterpenoid biosynthesis in yeast. ACS Synth Biol. 2020. 9(9): 2214-27(影响因子5.11,发表年月2020-08)

[44] 梁昕鑫,唐丹,霍毅欣*。蛋白源生物质的绿色生物转化。生物技术通报。2020. 36(12): 216(影响因子0.986,发表年月2020-07)

[43] Shengzhu Yu, Liwei Guo, Luyao Zhao, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo*. Metabolic engineering of E. coli for producing phloroglucinol from acetate. Appl Microbiol Biotechnol. 2020. 104(18): 7787-99(影响因子4.813,发表年月2020-07)

[42] Xiaoyan Ma, Lianjie Ma, Yi-Xin Huo*, Harnessing the hierarchy of transcriptional regulation: engineering of the gene expression network for efficient production, in Systems and Synthetic Metabolic Engineering. 2020, Elsevier. p. 107-24. (发表年月2020-07)

[41] Zhiqiu Yin, Jiaheng Liu, Binghai Du, Hai-Hua Ruan, Yi-Xin Huo*, Yuhui Du*, Jianjun Qiao*. Whole-Genome-Based survey for polyphyletic serovars of Salmonella enterica subsp. enterica provides new insights into public health surveillance. Int J Mol Sci. 2020. 21(15): 5226(影响因子5.924,发表年月2020-07)

[40] Jiakang Ru, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Microbial degradation and valorization of plastic wastes. Front Microbiol. 2020. 11: 442(影响因子5.64,发表年月2020-04)

[39] Said Nawab, Ning Wang*, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo. Genetic engineering of non-native hosts for 1-butanol production and its challenges: a review. Microb Cell Fact. 2020. 19(1): 1-16(影响因子3.681,发表年月2020-03)

[38] Tingting Ding, Chaoyong Huang, Zeyu Liang, Xiaoyan Ma*, Ning Wang*, Yi-Xin Huo. Reversed paired-gRNA plasmid cloning strategy for efficient genome editing in Escherichia coli. Microb Cell Fact. 2020. 19(1): 1-13(影响因子3.681,发表年月2020-03)

[37] Mengli Xia, Jialei Wang, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Mixta tenebrionis sp. nov., isolated from the gut of the plastic-eating mealworm Tenebrio molitor L. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(2): 790-6(影响因子2.747,发表年月2020-02)

[36] Lianjie Ma#, Liwei Guo#, Yunpeng Yang, Kai Guo, Yajun Yan, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo. Protein-based biorefining driven by nitrogen-responsive transcriptional machinery. Biotechnol Biofuels. 2020. 13(1): 1-14(影响因子6.04,发表年月2020-02)

[35] Huan Yu#, Zhenya Chen#, Ning Wang, Shengzhu Yu, Yajun Yan, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR for screening butanol overproducers. Metab Eng. 2019. 56: 28-38(影响因子9.783,发表年月2019-12)

[34] Chaoyong Huang, Tingting Ding, Jingge Wang, Xueqin Wang, Liwei Guo, Jialei Wang, Lin Zhu, Changhao Bi, Xueli Zhang, Xiaoyan Ma, Yi-Xin Huo*. CRISPR-Cas9-assisted native end-joining editing offers a simple strategy for efficient genetic engineering in Escherichia coli. Appl Microbiol Biotechnol. 2019. 103(20): 8497-509(影响因子4.813,发表年月2019-10)

[33] Liyuan Jin#, Said Nawab#, Mengli Xia, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. Context‐dependency of synthetic minimal promoters in driving gene expression: a case study. Microb Biotechnol. 2019. 12(6): 1476-86(影响因子5.813,发表年月2019-10)

[32] 杨云彭,马晓焉,霍毅欣*。密码子优化策略在异源蛋白表达中的应用。生物工程学报。2019. 35(12): 2227-37(影响因子0.977,发表年月2019-09)

[31] 郑博,王宁*,霍毅欣。基于转录和翻译调控的氨基酸高产菌株筛选及构建策略。生物技术通报。2020. 36(4): 34(影响因子0.986,发表年月2019-09)

[30] Xiaoyan Ma#, Xinxin Liang#, Yi-Xin Huo*. Developing a transformation-independent and unbiased qPCR assay to rapidly evaluate the determinants of DNA assembly efficiency. Engineering. 2019. 5(4): 803-10(影响因子7.553,发表年月2019-08)

[29] Zhenya Chen#, Luyao Zhao#, Jiakang Ru, Shengzhu Yu, Huan Yu, Huiyong Ren, Yuhong Zhang, Wei Zhang, Fankai Lin, Yi-Xin Huo*. A novel protein purification strategy mediated by the combination of CipA and Ssp DnaB intein. J Biotechnol. 2019. 301: 97-104(影响因子2.563,发表年月2019-08)

[28] Yi-Xin Huo, Bo Zheng, Ning Wang, Yunpeng Yang, Xinxin Liang, Xiaoyan Ma*. Identifying amino acid overproducers using rare-codon-rich markers. J Vis Exp. 2019. 148: e59331(影响因子1.355,发表年月2019-06)

[27] Jiao Zhang, Fayu Yang, Yunpeng Yang, Yu Jiang, Yi-Xin Huo*. Optimizing a CRISPR-Cpf1-based genome engineering system for Corynebacterium glutamicum. Microb Cell Fact. 2019. 18(1): 1-13(影响因子3.681,发表年月2019-03)

[26] Huan Yu, Ning Wang, Wenbo Huo, Yuhong Zhang, Wei Zhang, Yu Yang, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo*. Establishment of BmoR-based biosensor to screen isobutanol overproducer. Microb Cell Fact. 2019. 18(1): 1-11(影响因子3.681,发表年月2019-02)

[25] Yuan Yu, Pengcheng Chang, Huan Yu, Huiyong Ren, Danning Hong, Zeyan Li, Ying Wang, Hao Song, Yi-Xin Huo, Chun Li*. Productive amyrin synthases for efficient α-amyrin synthesis in engineered Saccharomyces cerevisiae. ACS Synth Biol. 2018. 7(10): 2391-402(影响因子5.11,发表年月2018-10)

[24] Bo Zheng#, Xiaoyan Ma#, Ning Wang, Tingting Ding, Liwei Guo, Xiaorong Zhang, Yu Yang, Chun Li, Yi-Xin Huo*. Utilization of rare codon-rich markers for screening amino acid overproducers. Nat Commun. 2018. 9(1): 1-11(影响因子14.919,发表年月2018-09)

[23] Yi-Xin Huo, Huiyong Ren, Huan Yu, Luyao Zhao, Shengzhu Yu, Yajun Yan, Zhenya Chen*. CipA-mediating enzyme self-assembly to enhance the biosynthesis of pyrogallol in Escherichia coli. Appl Microbiol Biotechnol. 2018. 102(23): 10005-15(影响因子4.813,发表年月2018-09)

[22] 彭瑞婷,夏孟丽,茹家康,霍毅欣,杨宇*。聚氨酯塑料的微生物降解。生物工程学报。2018. 34(9): 1398-409(影响因子0.977,发表年月2018-09)

[21] Ke Xu#, Bo Lv#, Yi-Xin Huo*, Chun Li*. Toward the lowest energy consumption and emission in biofuel production: combination of ideal reactors and robust hosts. Curr Opin Biotechnol. 2018. 50: 19-24(影响因子9.74,发表年月2018-04)

[20] 杨发誉,杨云彭,霍毅欣*。合成生物学中不依赖限制性内切酶的分子克隆策略。中国生物化学与分子生物学报2018. 34(4): 364-70(影响因子0.812,发表年月2018-04)

[19] Yi-Xin Huo, Liwei Guo, Xiaoyan Ma*. Biofuel production with a stress-resistant and growth phase-independent promoter: mechanism revealed by in vitro transcription assays. Appl Microbiol Biotechnol. 2018. 102(6): 2929-40(影响因子4.813,发表年月2018-02)

[18] Ming Zhu, Caixia Wang, Wentao Sun, Anqi Zhou, Ying Wang, Genlin Zhang, Xiaohong Zhou, Yi-Xin Huo, Chun Li*. Boosting 11-oxo-β-amyrin and glycyrrhetinic acid synthesis in Saccharomyces cerevisiae via pairing novel oxidation and reduction system from legume plants. Metab Eng. 2018. 45: 43-50(影响因子9.783,发表年月2018-01)

[17] Ke Xu, Liman Gao, Jalees Ul Hassan, Zhiping Zhao, Chun Li, Yi-Xin Huo, Guiyan Liu*. Improving the thermo-tolerance of yeast base on the antioxidant defense system. Chem Eng Sci. 2018. 175: 335-42(影响因子4.311,发表年月2018-01)

[16] Xiaoxue Wang, Dong Wang, Yi-Xin Huo, Dazhang Dai, Chihua Li, Chun Li, Guiyan Liu*. Identification of isoliquiritigenin as an activator that stimulates the enzymatic production of glycyrrhetinic acid monoglucuronide. Sci Rep-UK. 2017. 7(1): 1-10(影响因子4.38,发表年月2017-10)

[15] Yi-Xin Huo. Amino Acid Biosynthesis and Its Metabolic Engineering Applications. Engineering Microbial Metabolism for Chemical Synthesis. 2017: 69-95

[14] Xiaoyan Ma, Yi-Xin Huo*. The application of microfluidic-based technologies in the cycle of metabolic engineering. Syn Syst Biotechno. 2016. 1(3): 137-42(影响因子4.781,发表年月2016-09)

[13] Natasha K Vidangos, Johanna Heideker, Artem Lyubimov, Meindert Lamers, Yi-Xin Huo, Jeffrey G Pelton, Jimmy Ton, Jay Gralla, James Berger, David E Wemmer*. DNA recognition by a σ54 transcriptional activator from Aquifex aeolicus. J Mol Biol. 2014. 426(21): 3553-68(影响因子5.469,发表年月2015-10)

[12] Yuan-Tao Zhang, Feng Jiang, Zhe-Xian Tian, Yi-Xin Huo, Yi-Cheng Sun, Yi-Ping Wang*. CRP-cyclic AMP dependent inhibition of the xylene-responsive σ54-promoter Pu in Escherichia coli. PLoS One. 2014. 9(1): e86727(影响因子3.24,发表年月2014-01)

[11] Yi-Xin Huo, David G Wernick, James C Liao*. Toward nitrogen neutral biofuel production. Curr Opin Biotechnol. 2012. 23(3): 406-13(影响因子9.74,发表年月2012-06)

[10] Han Li, Paul H Opgenorth, David G Wernick, Steve Rogers, Tung-Yun Wu, Wendy Higashide, Peter Malati, Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, James C Liao*. Integrated electromicrobial conversion of CO2 to higher alcohols. Science. 2012. 335(6076): 1596(影响因子47.728,发表年月2012-05)

[9] Harsharan Singh Bhatia, Rahul Agrawal, Sandeep Sharma, Yi-Xin Huo, Zhe Ying, Fernando Gomez-Pinilla*. Omega-3 fatty acid deficiency during brain maturation reduces neuronal and behavioral plasticity in adulthood. PloS one. 2011. 6(12): e28451(影响因子3.24,发表年月2011-12)

[8] Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, Jimmy G Lafontaine Rivera, Emma Monte, Claire R Shen, Yajun Yan, James C Liao*. Conversion of proteins into biofuels by engineering nitrogen flux. Nat Biotechnol. 2011. 29(4): 346-51(影响因子54.908,发表年月2011-05)

[7] Yi-Xin Huo#, Yuan-Tao Zhang#, Yan Xiao, Xiaodong Zhang, Martin Buck, Annie Kolb, Yi-Ping Wang*. IHF-binding sites inhibit DNA loop formation and transcription initiation. Nucleic Acids Res. 2009. 37(12): 3878-86(影响因子16.971,发表年月2009-04)

[6] Jay D Gralla*, Yi-Xin Huo. Remodeling and activation of Escherichia coli RNA polymerase by osmolytes. Biochemistry. 2008. 47(50): 13189-96(影响因子3.163,发表年月2008-11)

[5] Yi‐Xin Huo, Adam Z Rosenthal, Jay D Gralla*. General stress response signalling: unwrapping transcription complexes by DNA relaxation via the sigma38 C‐terminal domain. Mol Microbiol. 2008. 70(2): 369-78(影响因子3.501,发表年月2008-09)

[4] Xian-Jun Mao#, Yi-Xin Huo#, Martin Buck, Annie Kolb, Yi-Ping Wang*. Interplay between CRP-cAMP and PII-Ntr systems forms novel regulatory network between carbon metabolism and nitrogen assimilation in Escherichia coli. Nucleic Acids Res. 2007. 35(5): 1432-40(影响因子16.971,发表年月2007-02)

[3] Yi-Xin Huo, Bei-Yan Nan, Cong-Hui You, Zhe-Xian Tian, Annie Kolb, Yi-Ping Wang*. FIS activates glnAp2 in Escherichia coli: role of a DNA bend centered at −55, upstream of the transcription start site. FEMS Microbiol Lett. 2006. 257(1): 99-105(影响因子2.742,发表年月2006-04)

[2] Yi‐Xin Huo#, Zhe‐Xian Tian#, Mathieu Rappas, Jin Wen, Yan‐Cheng Chen, Cong‐Hui You, Xiaodong Zhang, Martin Buck, Yi‐Ping Wang*, Annie Kolb. Protein‐induced DNA bending clarifies the architectural organization of the σ54‐dependent glnAp2 promoter. Mol Microbiol. 2006. 59(1): 168-80(影响因子3.501,发表年月2006-01)

[1] Yi‐Xin Huo. Activité de promoteurs dépendant de sigma54 et courbure de l'ADN induite par des protéines/sous la direction de Yi-Ping Wang, Annie Kolb. 2005. Thèse soutenue en co-tutelle. - Thèse de doctorat: Microbiologie: Université de Pékin: 2005 Thèse de doctorat: Microbiologie: Paris 7: 2005

国际/国家专利

23. 陈振娅,霍毅欣,赵璐瑶。一种高效简便纯化蛋白的方法。CN 110714020 A

22. 霍毅欣,陈振娅,赵璐瑶。一种高效简便的酶固定化的方法。CN 110563852 A

21. 霍毅欣,马晓焉,马炼杰。一种实现生物燃料稳定生产的方法。CN 110551768

20. 霍毅欣,马晓焉,郭丽微。一种利用σ70非依赖型抗胁迫启动子实现异丁醛稳定高产的方法。CN 110551770 A

19. 霍毅欣,陈振娅,于盛竹。一种间苯三酚的生产方法。CN 110551769 A

18. 霍毅欣,黄潮勇。一种基于细菌内源同源重组系统的基因组编辑方法。CN 110669779 A

17. 霍毅欣,郑博,王宁。一种利用稀有密码子在翻译水平调控基因表达的方法。CN 110592126 A

16. 霍毅欣,郑博,王宁,马晓焉。一种非极性氨基酸高产菌株的筛选方法。CN 108707576 A

15. 霍毅欣,郑博,王宁,马晓焉。一种支链氨基酸高产菌株的筛选方法。CN 108795966 A

14. 霍毅欣,黄潮勇。一种基于细菌内源末端连接系统的基因组编辑方法。CN 110628761 A

13. 霍毅欣,郑博,王宁,马晓焉。一种极性氨基酸高产菌株的筛选方法。CN 108795965 A

12. 霍毅欣,郭丽微,刘玉美。一种利用新型dCas9调控基因表达的方法。CN 110607317 A

11. 杨宇,茹家康,霍毅欣。一种重组聚氨酯塑料降解酶的制备方法及应用。CN 111172132 A

10. 霍毅欣,王会艳,王宁。一种印楝素合成前体的底盘生产菌株WHY-60。CN 111944709 A

9. 霍毅欣,王会艳,王宁。一种印楝素合成关键中间体的相关基因。CN 111944797 A

8. 霍毅欣,陈振娅,蔚欢。一种高效筛选异丁醇高产菌株的BmoR突变体。CN 110615832 A

7. 霍毅欣,王雪芹,黄潮勇。一种效率高且成本低的无缝DNA组装方法。CN 110592130 A

6. 霍毅欣,王靖格,黄潮勇。一株基于大肠杆菌改造的工程菌株。CN 110616181 A

5. Huo, Y.X., Schilling, B., and Rabizadeh, S. (2014) Improved carbon dioxide fixation via bypassing feedback regulation. WO application pending.

4. Huo, Y.X., Rohlin, L., and Rabizadeh, S. (2014) Microbial production of fuel components from low-molecular weight gas mixture. US9512450B1.

3. Huo, Y.X. and Cho. K.M. (2013) Two stage production of higher alcohols. WO 2014/028642.

2. Liao,J.C., Cho, K.M., Yan, Y and Huo, Y.X. (2011) Chemical production by recombinant microorganisms via fermentation of proteinacious biomass. WO 2012/061653.

1. Liao,J.C., Cho, K.M., Yan, Y and Huo, Y.X. (2011) Biofuel and chemical production by recombinant microorganisms via fermentation of proteinacious biomass. US9284566B2

学科建设

       现任北京理工大学生命学院副院长(分管研究生招生与培养)、生物工程专业责任教授、生物技术专业责任教授、工业和信息化部“分子医学与生物诊疗”重点实验室副主任。在2018年作为“生物化学与分子生物学”的学科方向带头人助力北京理工大学生命学院成功获批生物学一级学科博士点。作为责任教授获批生物技术专业的北京市一流专业。

人才培养

       四名博士后入职北京理工大学和中国农科院等科研院所,培养的博士研究生郑博、郭丽微入选CSC项目。四名本科生在本实验室完成毕业设计并被评为优秀等级,四名本科生获得北京理工大学优秀毕业生。一名本科生获北京市优秀毕业论文。两名硕士生论文被评为北京理工大学优秀毕业论文,两名硕士生获得北京理工大学优秀毕业生。十余人次的研究生或本科生获得国家奖学金、工信部创新创业奖学金等省部级奖学金。十一名硕士生进入高校或科研院所攻读博士学位。

科学研究

       一直致力于解决绿色生物制造的关键基础科学与技术问题,围绕“天然资源的微生物精炼与制造”,以合成生物学为核心,以“人工细胞工厂的设计-构建-筛选-放大”为主线,以多种模式生物为研究对象,取得了一系列科研成果。入职北理工以来共发表高水平论文53篇,代表作被收录于Nat Commun、Metab Eng、Engineering等权威期刊。入职北理工前发表高水平论文12篇,其中5篇发表于Science、Nat Biotechnol、Nucleic Acids Res和Curr Opin Biotech。申请二十余项国际、国内专利,其中3项美国专利和多个国内专利已授权。主持自然科学基金委国际合作项目、国家重点研发计划课题、科技创新特区等十余项项国家、省部及地区级项目。

公共服务

       现任中国生物工程学会理事、中国生物工程学会青年工作委员会副主任、中国化工学会生物化工青年学者工作委员会常务委员、中国生物工程学会氨基酸专业委员会委员、美国化工学会(AICHE)资深会员和美国生物化学学会(ASBMB)会员等。曾担任教育部长江学者、国家自然科学基金委面上及青年项目的函评专家等。曾担任美国化学年会的分会主席。担任农工民主党北京理工大学支部副主委。

教育教学

       在北理工任教期间,主讲7门本科生课程,4门研究生课程。课程内容较为全面,涵盖生命科学基础、生物工程与技术导论、(英)现代生命科学与技术述评、分子生物学、生物化学等基础课程,也有国内外生物/医药类创业企业的最新成功及失败案例、绿色合成与智能制造等产业化分析课程,以及合成生物学等专业课程。同时积极参加教育教学改革项目,发表两篇教改论文:马晓焉,陈振娅,霍毅欣,基于读图的生物学专业能力考查;陈振娅,马晓焉,霍毅欣,基于科学前沿的“一体式”微生物学开放实验课程探索。

团队成员(加了链接):

马晓焉特别副研究员

陈振娅特别副研究员

孙丽超特别副研究员

邹   沁特别副研究员

郭   昊博士



生物系教师简介——郭  昊 助理研究员 特立博士后


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基本信息:

郭昊,助理研究员,特立博士后

办公室:中关村校区临建楼A213(图书馆正门对面)

邮箱:7520190176@bit.edu.cn

教育背景:

2016-2019,RWTH-Aachen University,Germany 博士

2012-2015,山东大学,微生物技术国家重点实验室 硕士

工作经历:

2019-至今,北京理工大学,生命学院,助理研究员,特立博士后

研究方向:

       面向合成生物学与绿色生物制造,开发高值化学品的生物合成途径、新功能元件、高版本底盘及高效微生物细胞工厂。针对目前利用微生物生产各类高价值化合物的过程中,发酵产量低,效率差等问题,利用代谢工程、蛋白质工程、基因工程等策略,设计模式生物底盘细胞,显著提高各种高附加值化合物的产量及效率,实现微生物细胞工厂的构建。建立了首个三萜类化合物平台菌株,通过优化三萜合成途径,优化培养基成分与发酵条件,将各种三萜类化合物的产量提高至5 g/L,显著提高各类三萜化合物的产量。研究成果在ACS Synthetic Biology等高水平期刊发表,研究方向包括但不限于:

(1) 功能元件:酶蛋白、非天然蛋白、核酸元件的人工设计

(2) 底盘细胞:转录调控,代谢流重定向,鲁棒性细胞工厂

(3) 目标产品:氨基酸、生物燃料、药物前体的生物合成

科研项目:

1. 国家重点研发计划,高效微生物细胞工厂的设计原理与构建方法,2021.07-2024.06,子课题负责人,55万

专利:

1. 一种适用于筛选高产非蛋白质氨基酸的菌株的方法 霍毅欣,马晓焉,郭昊,孙丽超 申请号: 2021115993799

2. 一种适用于筛选高产天然氨基酸的菌株的方法 霍毅欣,马晓焉,郭昊,孙丽超 申请号: 2021115976670

代表性论文:

[1] Guo, H.; Wang, H.; Huo, Y.-X., Engineering Critical Enzymes and Pathways for Improved Triterpenoid Biosynthesis in Yeast. ACS Synth. Biol. 2020, 9 (9), 2214-2227.(一区Top)

[2] Wang, H., Guo, H., Wang, N. & Huo, Y.-X. Toward the Heterologous Biosynthesis of Plant Natural Products: Gene Discovery and Characterization. ACS Synthetic Biology 10, 2784-2795, (2021).(一区Top)


培养学生介绍:

部分博士后及毕业生去向:

1. 杜宇辉 博士后 现为华南理工大学助理教授/副研究员(已参与发表文章:[61],[41])

2. 王宁 博士后 现为中国农科院作科所助理研究员(已参与发表文章:[61],[57],[53],[50],[49],[46],[39],[38],[35],[31],[28],[26],[24])

3. 郑博 2016级 化学工程与技术专业博士研究生 现就职清华大学博士后流动工作站(已参与发表文章:[55],[31],[28],[24])

4. 王会艳 2016级 化学工程与技术专业博士研究生 现就职北京华熙荣熙生物技术研究有限公司 研发工程师(已参与发表文章:[60],[53],[49],[45])

5. 蔚欢 2016级 硕士研究生 现就读于天津大学 攻读博士学位(已参与发表文章:[35],[29],[26],[25],[23])

6. 张姣 2016级 硕士研究生 现就读于中国科学院植物生理生态研究所 攻读博士学位(已参与发表文章:[27])

7. 赵璐瑶 2017级 硕士研究生 现就读于瑞典皇家理工学院 攻读博士学位(已参与发表文章:[54],[43],[29],[23])

8. 杨云彭 2017级 硕士研究生 现就职于北京市专利局(已参与发表文章:[36],[32],[28],[27],[20])

9. 梁昕鑫 2017级 硕士研究生 现就职于北京市工业技师学院 教师(已参与发表文章:[44],[30],[28])

在读研究生:

碳中和—底盘改造方向

定婷婷 2018级 生物医学工程专业博士研究生(硕博连读)

邮箱:dtting13@sina.com ,已参与发表文章:[38],[34],[24]

马炼杰 2020级 生物学专业 博士研究生(硕博连读)

邮箱:380938548@qq.com ,已参与发表文章:[52],[51],[50],[42],[36]

霍晨曦 2021级 生物学专业 博士研究生(硕博连读)

邮箱:1104506146@qq.com

郭子沐 2021级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:353375498@qq.com

基因编辑

黄潮勇 2019级 生物医学工程专业 博士研究生(硕博连读)

邮箱:1557424651@qq.com ,已参与发表文章:[50],[46],[38],[34]

唐丹 2020级 生物学专业 博士研究生

邮箱:tangdanifonly@163.com ,已参与发表文章:[44]

梁泽宇 2021级 生物学专业 博士研究生

邮箱:lzy163_96@163.com ,已参与发表文章:[38]

杨超 2020级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:1794873287@qq.com

赵鹏卓 2021级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:17852227832@163.com

代谢工程方向

郭丽微 2018级 生物医学工程专业 博士研究生

邮箱:guoliwei118@163.com ,已参与发表文章:[58],[46],[43],[36],[34],[24],[19]

于盛竹 2019级 生物医学工程专业 博士研究生(硕博连读)

邮箱:ysz9604@126.com ,已参与发表文章:[55],[54],[43],[35],[31],[29],[23]

陈彤彤 2019级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:chentongtong1216@163.com ,已参与发表文章:[59]

刘玉美 2019级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:2421972336@qq.com

章无怨 2021级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:1793808978@qq.com

酶工程方向

毋彤 2020级 生物学专业 博士研究生(硕博连读)

邮箱:501839380@qq.com ,已参与发表文章:[56],[54]

朱涵容 2020级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:3120201427@bit.edu.cn

妥俊恺 2020级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:15810967886@163.com

李敏 2021级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:zxhy_xsyy@163.com

生物信息学方向

孟祥瑜 2020级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:mxyumxy@163.com

郭樱杰 2021级 生物学专业 硕士研究生

邮箱:joy_kwok1998@163.com



求才若渴

团队常年招收海内外在合成生物学、代谢工程、酶工程、生物信息学等领域的有志之士

招收岗位:教授/研究员、副教授/副研究员、助理教授、博士后、博士生、硕士生

薪酬待遇:参考北京理工大学相应岗位聘用待遇薪酬

联系方式:手机/微信:18910254522,邮箱:huoyixin@bit.edu.cn