智慧生物学系
霍毅欣 教授 / 博士生导师
霍毅欣
北京理工大学特聘教授（二级）、博士生导师
国家级领军人才（2022年入选）、国家级青年人才（2015年入选）
生命学院副院长、中国生物工程学会理事
北京理工大学学科专业责任教授（生物学学科、生物技术本科专业）
2024年第十四届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛主赛道金奖指导教师
邮箱：huoyixin@bit.edu.cn 电话：18910254522
教育经历
2008-08至2011-07，加州大学洛杉矶分校，博士后，导师：James C. Liao教授（美国科学院院士、美国工程院院士、美国国家发明家科学院院士，第三世界科学院院士、台湾中央研究院院士、现任台湾中央研究院院长）
2006-05至2008-08，加州大学洛杉矶分校，博士后，导师：Jay D. Gralla教授
2002-09至2005-12，巴黎第七大学，分子微生物学及病毒学，博士（联合培养、分别获得中法两国博士学位），导师：Annie Kolb研究员
2000-09至2005-12，北京大学，生物化学及分子生物学，博士，导师：王忆平教授
1995-09至1999-06，南开大学，微生物学，学士
科研与学术工作经历
2023年8月至今，北京理工大学， 生命学院，特聘教授（二级教授）
2021-01至2023年8月，北京理工大学，生命学院，长聘教授（三级教授）
2019-10至今，北京理工大学，生命学院，副院长（分管研究生、学科）
2019-09至今，北京理工大学，生命学院，生物技术专业责任教授
2019-01至今，北京理工大学，工业和信息化部“分子医学与生物诊疗”重点实验室，副主任
2017-09至2020-12，北京理工大学，生命学院，生物工程专业责任教授
2015-09至2020-12，北京理工大学，生命学院，教授
2014-11至2015-09，加州大学洛杉矶分校苏州先进技术研究院，生物能源研究中心，实验室主任（兼）
2011-08至2015-09，Nantworks集团Easel生物技术公司，项目主管、资深研究员
研究方向
计算生物学：基于深度学习的DNA和酶设计；微生物进化机制
基因编辑：原核、真核细胞的基因编辑、高鲁棒性底盘宿主构建；方法学开发
碳中和：二氧化碳的资源化，以固碳微生物实现二氧化碳的高值转化
代谢工程：大宗化学品、药物中间体的微生物合成途径构建及高效生产
酶工程：塑料降解酶；生物传感器的研发
团队成员（加了链接）：
合作教授：郭淑元教授
代表性教学成果：
1. 第十四届“挑战杯”秦创原中国大学生创业计划竞赛（2024年），全国金奖，指导教师：霍毅欣、陈振娅、孙丽超、邹沁、马晓焉
2. “青创北京”2024年“挑战杯”首都大学生创业计划竞赛，北京市金奖，指导教师：霍毅欣、陈振娅、孙丽超、邹沁、马晓焉
3. “青创北京”2023年“挑战杯”首都大学生课外学术科技作品竞赛“黑科技”专项赛，北京市一等奖，指导教师：霍毅欣、孙丽超、陈振娅
4. 2020年北京市优秀本科毕业论文指导教师，霍毅欣
5. 延根赓续、自力更“生” ——大国博弈背景下的我国生物学创新人才培养实践，获北京理工大学教育教学成果二等奖，霍毅欣、马晓焉、郭淑元、陈振娅、周连景、孙丽超、邹沁、安宜、张桔
代表作（15篇）
[87] Yan Xia, Xiaowen Du, Bin Liu, Shuyuan Guo*, Yi-Xin Huo*. Species-specific design of artificial promoters by transfer-learning based generative deep-learning model. Nucleic Acids Research. 2024 May 23:gkae429. doi: 10.1093/nar/gkae429. Online ahead of print. （发表当年影响因子16.6，发表日期2024年6月）
针对非模式生物启动子训练数据集不足的问题，用迁移学习大模型实现对27种原核生物的物种特异性启动子的生成。
[86] Tingting Ding, Zeyu Liang, Yu Yang, Jing Liu, Wenting Li, Yuhui Du, Zhenya Chen, Yi-Xin Huo*. Rapidly engineering an osmotic-pressure-tolerant gut bacterium for efficient non-sterile production of bulk chemicals. Chemical Engineering Journal. 2024 July 1. doi.org/10.1016/j.cej.2024.152076. （发表当年影响因子13.3，发表日期2024年7月）
从昆虫肠道中分离出来一种耐盐底盘菌株并建立全套基因编辑方法，可以高盐、非灭菌、非粮底物高效生产大宗化学品。
[85] Zeyu Liang, Chaoyong Huang, Yan Xia, Zhaojin Ye, Shunhua Fan, Junwei Zeng, Shuyuan Guo, Xiaoyan Ma, Lichao Sun, Yi-Xin Huo*. Identification of functional sgRNA mutants lacking canonical secondary structure using high-throughput FACS screening. Cell Reports. 2024 May 31;43(6):114290. doi: 10.1016/j.celrep.2024.114290. Online ahead of print. （发表当年影响因子8.8，发表日期2024年6月）
筛选到2000余种完全失去经典二级结构的、序列高度变异的（up to 80%序列不同）、有（完全）活性的sgRNA，用于克服基因编辑中的重组和脱靶问题。
[84] Zhenya Chen, Shengzhu Yu, Jing Liu, Liwei Guo, Tong Wu, Peifeng Duan, Dongli Yan, Chaoyong Huang, Yi-Xin Huo*. Concentration Recognition-Based Auto-Dynamic Regulation System (CRUISE) Enabling Efficient Production of Higher Alcohols. Advanced Science. 2024 Apr 16:e2310215. doi: 10.1002/advs.202310215. （发表当年影响因子15.1，发表日期2024年4月）
在氨基酸衍生物生产过程中实现胞内氨基酸浓度的动态调控，克服其因转化造成的浓度不足对底盘细胞的生长抑制问题。
[81] Zeyu Liang, Zhaojin Ye, Yan Xia, Xiaowen Du, Shunhua Fan, LiChao Sun, ShuYuan Guo* Yi-Xin Huo*. Low-cost and rapid construction of green energy overproducers based on the CRISPR system. 2024. Chemical Engineering Journal. （发表当年影响因子13.3，接收日期2024-12）
[73] Yan Xia#, Lichao Sun#, Zeyu Liang, Yingjie Guo, Jing Li, Dan Tang, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, The construction of a PAM-less base editing toolbox in Bacillus subtilis and its application in metabolic engineering, Chemical Engineering Journal, 2023, 469:143865. DOI: 10.1016/j.cej.2023.143865 (发表当年影响因子16.744，发表年月 2023-05)
[72] Hao Guo#, Ning Wang#, Tingting Ding, Bo Zheng, Liwei Guo, Chaoyong Huang, Wuyuan Zhang, Lichao Sun, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. A tRNA Modification-based strategy for Identifying amiNo acid Overproducers (AMINO). Metab Eng. 2023. 78: 11-25. (发表当年影响因子8.4，发表年月 2023-07)
[64] Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Using genome and transcriptome analysis to elucidate biosynthetic pathways. Curr Opin Biotechnol. 2022, 75: 102708. （发表当年影响因子10.279，发表年月2022-06）
[56] Tong Wu#, Zhenya Chen#, Shuyuan Guo, Cuiying Zhang, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR mutants for constructing multifunctional alcohol biosensors. ACS Synth Biol. 2021（发表当年影响因子5.11，发表年月2022-02）
[52] Xiaoyan Ma#, Lianjie Ma#, Yi-Xin Huo*. Reconstructing the transcription regulatory network to optimize resource allocation for robust biosynthesis. Trends Biotechnol. 2021（发表当年影响因子21.932，发表年月2021-11）
[35] Huan Yu#, Zhenya Chen#, Ning Wang, Shengzhu Yu, Yajun Yan, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR for screening butanol overproducers. Metab Eng. 2019. 56: 28-38（影响因子9.783，发表年月2019-12）
[24] Bo Zheng#, Xiaoyan Ma#, Ning Wang, Tingting Ding, Liwei Guo, Xiaorong Zhang, Yu Yang, Chun Li, Yi-Xin Huo*. Utilization of rare codon-rich markers for screening amino acid overproducers. Nat Commun. 2018. 9(1): 1-11（影响因子14.919，发表年月2018-09）
[11] Yi-Xin Huo, David G Wernick, James C Liao*. Toward nitrogen neutral biofuel production. Curr Opin Biotechnol. 2012. 23(3): 406-13（影响因子9.74，发表年月2012-06）
[10] Han Li, Paul H Opgenorth, David G Wernick, Steve Rogers, Tung-Yun Wu, Wendy Higashide, Peter Malati, Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, James C Liao*. Integrated electromicrobial conversion of CO2 to higher alcohols. Science. 2012. 335(6076): 1596（影响因子47.728，发表年月2012-05）
[8] Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, Jimmy G Lafontaine Rivera, Emma Monte, Claire R Shen, Yajun Yan, James C Liao*. Conversion of proteins into biofuels by engineering nitrogen flux. Nat Biotechnol. 2011. 29(4): 346-51（影响因子54.908，发表年月2011-05）
科研项目及获奖
（一） 入职北理工后
主持项目：
13、科学技术部国家重点研发计划，合成生物学专项，基因密码子扩展技术及功能蛋白定向改造，课题一：原核生物中高效基因密码子拓展系统的构建及应用（课题负责人，500万），2024/12-2029/11，主持
12、国家自然科学基金委员会，面上项目，32371489，半理性设计RNA聚合酶提高微生物细胞工厂生产性能，2024/01-2027/12，50万，主持
11、科学技术部国家重点研发计划，合成生物学专项，2019YFA0904104，非天然氨基酸生物合成及其适配底盘的设计及应用，2020/01-2024/12，536万元，在研，主持（课题负责人，为项目2019YFA0904100的课题四）
10、科学技术部国家重点研发计划，绿色生物制造专项，2021YFC2100500，高效微生物细胞工厂的设计原理与构建方法，2021/07-2024/06，在研，子课题负责人
9、国家自然科学基金委员会国际合作项目，31961133014，塑料解聚及资源化微生物菌群的人工构建，2020/01-2023/12，在研，参加
8、济南市“高校20条”资助项目，发酵废弃物的微生物高值转化，2019/12-2021/12，已结题，主持
7、北京理工大学科技创新计划，二氧化碳的微生物固定，2019/01-2021/12，已结题，主持
6、国家自然科学基金委员会重点项目，21736002，微生物合成萜烯化合物过程中的跨膜转运与代谢传质强化，2018/01-2022/12，在研，参加
5、科学技术部国家重点研发计划，2017YFD0201400，天然绿色生物农药的合成生物学与组合合成技术，2017/01-2021/06，已结题，子课题负责人
4、国家自然科学基金委员会，面上项目，21676026，α-香树酯醇的酶法异构机理及其微生物合成，2017/01-2020/12，已结题，主持
3、江苏省双创人才，2016/01-2018/12，已结题，主持
2、国家级青年项目，2016/07-2018/06，已结题，主持
1、北京理工大学优秀青年教师资助计划，利用微生物实现二氧化碳的资源化，2016/07-2018/06，已结题，主持
团队主持项目：
马晓焉：
1. 国家自然科学基金，基于密码子扩展的氨基酸高产菌株的筛选及菌株重构，2021.01-2023.12，负责人，24万
2. 国家重点研发计划，针对神经退行性疾病的合成肠道菌群体系构建及应用，2020.01-2024.12，子课题负责人，145万
3. 国家自然科学基金重大研究计划，厌氧硫氧化作用的能量偶合反应多样性及与其他元素循环的关联，2020.01-2022.12，课题负责人，25万
4. 北京理工大学“青年教师学术启动计划”，通过改造RNA聚合酶提高胁迫条件下微生物细胞工厂鲁棒性的研究，2020/01-2022/12，40万，在研，主持
5. 中国博士后面上基金，兼性自养微生物CO2固定途径的反馈抑制及其解除研究，2017/11-2019/10，5万元，主持
陈振娅：
1. 科学技术部国家重点研发计划，绿色生物制造专项，2021YFC2100500， 2021/07-2024/06，子课题负责人
2. 河北省自然基金面上项目，B2023105008，2023/01-2025/12，主持
3. 国家自然科学基金面上项目，22278033，2023/01-2026/12，主持
4. 北京理工大学科技创新计划科研基地支撑专项计划，2021/01-2021/12，主持
5. 国家自然科学基金青年科学基金项目，21908007，2020/01-2022/12，主持
6. 北京理工大学“青年教师学术启动计划”, 2020/01-2022/12，主持
7. 63批博士后科学基金面上一等资助，2018M630083，2018/05-2019/12，主持
孙丽超：
1. 河北省自然科学基金面上项目，基于氨基酸资源分配的代谢调控策略及其在异丁醇生产中的应用（C2023105022），2023/01-2025/12
2. 北京市自然科学基金面上项目，生物基异丁醛合成过程的动态精准调控（2222026），2022/01-2024/12
3. 北京理工大学科技创新计划，氨基酸衍生物的高效微生物合成研究，2021/03-2024/06
4. 国家自然科学基金青年项目，香兰素合成酶阿魏酰辅酶A连接酶（FCS）底物识别及催化机制（31700701），2018/01-2020/12
5. 生物反应器工程国家重点实验室开放课题项目，类胡萝卜素裂解加氧酶CSO2底物识别及催化机制（2018OPEN13），2018/09-2020/08
邹沁：
1. 国家自然科学基金青年项目，2025/01-2027/12，主持
2. 山东省自然科学基金面上项目，2025/01-2027/12，主持
3. 河北省自然科学基金面上项目，2023/01-2025/12，主持
4. 北京理工大学“青年教师学术启动计划”，2022/01-2024/12，主持
5. 清华大学-北京大学生命科学联合中心清华优秀博士后基金，2020/01-2021/12，主持
6. 清华大学自主科研计划，新型异链嵌合体RNA的系统鉴定与分析，2019/07-2020/06，40万，已结题
7. 清华大学自主科研计划，肝细胞癌肿瘤组织内成与功能机制的系统研究，2015/03-2017/12，50万，已结题
8. 清华大学自主科研计划，核糖体蛋白翻译过程的应激调控机制， 2014/01-2016/12，59万，已结题
（二）入职北理工前主持项目
1.Bio-Oxo Technologies, Awarded by Department of Energy (DOE), No. DE-EE0005773, 2014/12-2016/12, Total: 2.5 millions US dollars, 主持
2.Electro-Autotrophic Synthesis of Higher Alcohols, Awarded by Department of Energy (DOE), No. AR0000085, PI: James Liao (UCLA), Year 2010-2014, Total: 4 million US dollars, Co-PI（共同主持）
3.NIH Research Grant 5 R01 GM035754:2, 参与
4.NIH Research Grant 5 R01 GM049048:11, 参与
5.Internal Fund for UCLA-Department of Energy Institute for Genomics and Proteomics (DOE, 2008-2011), 参与
6.Sino - French Advanced Research Program (PRA) (2002-2005), 参与
7.China–Ireland Science and Technology Collaboration Research Fund (2002-2005),参与
8.Finalist of Chancellor’s Postdoctoral Award, UCLA (2011)
9.GuangHua Doctoral candidate Award, Peking University (2004)
10.French governmental CNOUS Fellowship Award (2002-2005)
11.Honorable Award for undergraduate students in Biology, Nankai University (1996)
总文章列表
[92] Application Evaluation and Performance-Directed Improvement of the Native and Engineered Biosensors Min Li, Zhenya Chen*, and Yi-Xin Huo*, ACS Sensors 2024 9 (10), 5002-5024. DOI: 10.1021/acssensors.4c01072 （影响因子8.2, 发表日期2024-10）
[91] Pengyu Dong, Yunjuan Fan, Yi-Xin Huo, Lichao Sun*, Shuyuan Guo*, A pathway-adapted biosensor for high-throughput screening of O-methyltransferase and its application in vanillin synthesis. ACS Synthetic Biology, 2024. https://doi.org/10.1021/acssynbio.4c00287. （发表当年影响因子3.7，发表日期2024年9月）
[90] Yingjie Guo, Yan Xia, Zeyu Liang, Shenyan Yang, Shuyuan Guo, Lichao Sun*, Yi-Xin Huo*, Plasmid-stabilizing strains for antibiotic-free chemical fermentation. ACS Synthetic Biology, 2024. https://doi.org/10.1021/acssynbio.4c00241. （发表当年影响因子3.7，发表日期2024年8月）
[89] Jiawei Li#, Jiunwei Tseng#, Dan Tang, Yunqian Yonga, Lichao Sun*, Yi-Xin Huo*, Upcycling C1 gas-derived resources in future food system. Resources, Conservation & Recycling, 2024, 210: 107827. https://doi.org/10.1016/j.resconrec.2024.107827.（发表当年影响因子11.2，发表日期2024年11月）
[88] 孙丽超, 赵鹏卓, 胡伟, 霍毅欣*, 空间微生物研究及其航天应用. 生物学杂志, 2024, 录用.
[87]Yan Xia, Xiaowen Du, Bin Liu, Shuyuan Guo*, Yi-Xin Huo*. Species-specific design of artificial promoters by transfer-learning based generative deep-learning model. Nucleic Acids Research. 2024 May 23:gkae429. doi: 10.1093/nar/gkae429. Online ahead of print. （发表当年影响因子16.6，发表日期2024年6月）
针对非模式生物启动子训练数据集不足的问题，用迁移学习大模型实现对27种原核生物的物种特异性启动子的生成。
[86] Tingting Ding, Zeyu Liang, Yu Yang, Jing Liu, Wenting Li, Yuhui Du, Zhenya Chen, Yi-Xin Huo*. Rapidly engineering an osmotic-pressure-tolerant gut bacterium for efficient non-sterile production of bulk chemicals. Chemical Engineering Journal. 2024 July 1. doi.org/10.1016/j.cej.2024.152076. （发表当年影响因子13.3，发表日期2024年7月）
从昆虫肠道中分离出来一种耐盐底盘菌株并建立全套基因编辑方法，可以高盐、非灭菌、非粮底物高效生产大宗化学品。
[85] Zeyu Liang, Chaoyong Huang, Yan Xia, Zhaojin Ye, Shunhua Fan, Junwei Zeng, Shuyuan Guo, Xiaoyan Ma, Lichao Sun, Yi-Xin Huo*. Identification of functional sgRNA mutants lacking canonical secondary structure using high-throughput FACS screening. Cell Reports. 2024 May 31;43(6):114290. doi: 10.1016/j.celrep.2024.114290. Online ahead of print. （发表当年影响因子8.8，发表日期2024年6月）
筛选到2000余种完全失去经典二级结构的、序列高度变异的（up to 80%序列不同）、有（完全）活性的sgRNA，用于克服基因编辑中的重组和脱靶问题。
[84] Zhenya Chen, Shengzhu Yu, Jing Liu, Liwei Guo, Tong Wu, Peifeng Duan, Dongli Yan, Chaoyong Huang, Yi-Xin Huo*. Concentration Recognition-Based Auto-Dynamic Regulation System (CRUISE) Enabling Efficient Production of Higher Alcohols. Advanced Science. 2024 Apr 16:e2310215. doi: 10.1002/advs.202310215. （发表当年影响因子15.1，发表日期2024年4月）
在氨基酸衍生物生产过程中实现胞内氨基酸浓度的动态调控，克服其因转化造成的浓度不足对底盘细胞的生长抑制问题。
[83] Yan Xia, Zeyu Liang, Xiaowen Du, Dengtian Cao, Jing Li, Lichao Sun,b, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, Design nonrepetitive and diverse activity single-guide RNA by deep learning, 2024. Biorxiv.
[82] Yan Xia, Xiaowen Du, Zeyu Liang, Zhaojin Ye, Dengtian Cao, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, CRISPR-Cas9/SpRY-mediated rapid and universal genome editing in Bacillus subtilis, 2024. (Submitted)
[81] Zeyu Liang, Zhaojin Ye, Yan Xia, Xiaowen Du, Shunhua Fan, LiChao Sun, ShuYuan Guo* Yi-Xin Huo*. Low-cost and rapid construction of green energy overproducers based on the CRISPR system. 2024. Chemical Engineering Journal. （发表当年影响因子13.3，接收日期2024-12）
[80] Chenxi Huo, Lianjie Ma, Ping Liu, Liyuan Jin, Dongli Yan, Zekun Yu, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. Unveiling the differentiated stress-adaptation-induced mutation hotspots in bacterial transcription machinery evolved under natural and laboratory conditions. 2024. (in revision)
[79] Lianjie Ma, Chenxi Huo, Zekun Yu, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. Reassigning core RNA polymerase to different sigma factors through mutations in interaction domains. 2024. (submitted)
[78] Dengtian Cao, Yan Xia, Zhongrao Han, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. Simplified Construction of Engineered Bacillus subtilis for Protein harboring Site-Specific Incorporation of Two Noncanonical Amino Acids. 2024. (To be submitted)
[77] Yan Xia#, Lichao Sun#, Zeyu Liang, Zhongrao Han, Jing Li, Yingjie Guo, Pengyu Dong, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, Chromosome segment scanning for gain- or loss-of-function screening (CHASING) and its application in metabolic engineering. 2024. (submitted)
[76] Haojie Jin, Jiaqi Zhang, Yan Wang, Wanzhao Ge, Yike Jing, Xiaoyu Cao, Yixin Huo, Yujie Fu*, A codon-based live-cell biomonitoring system for assessing intracellular phenylalanine bioavailability in cyanobacteria, Biosensors and Bioelectronics, 2024, 115792. DOI: 10.1016/j.bios.2023.115792. (影响因子10.7，发表年月 2024-01)
[75] Ying Liu, Lichao Sun*, Yi-Xin Huo, Shuyuan Guo*, Strategies for improving the production of bio-based vanillin, Microbial Cell Factories, 2023, 22(1):147. DOI: 10.1186/s12934-023-02144-9. (影响因子6.4，发表年月 2023-08)
[74] Zhenya Chen, Tong Wu, Shengzhu Yu, Min Li, Xuanhe Fan, Yi-Xin Huo*. Self-assembly systems to troubleshoot metabolic engineering challenges. Trends in Biotechnology. 2024, 42(1):43-60. （发表当年影响因子14.3，发表年月 2024-01）
[73] Yan Xia#, Lichao Sun#, Zeyu Liang, Yingjie Guo, Jing Li, Dan Tang, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, The construction of a PAM-less base editing toolbox in Bacillus subtilis and its application in metabolic engineering, Chemical Engineering Journal, 2023, 469:143865. DOI: 10.1016/j.cej.2023.143865 (发表当年影响因子16.744，发表年月 2023-05)
[72] Hao Guo#, Ning Wang#, Tingting Ding, Bo Zheng, Liwei Guo, Chaoyong Huang, Wuyuan Zhang, Lichao Sun, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. A tRNA Modification-based strategy for Identifying amiNo acid Overproducers (AMINO). Metab Eng. 2023. 78: 11-25 (发表当年影响因子8.4，发表年月 2023-07)
[71] Hao Guo, Tongtong Chen, Hanrong Zhu, Huiyan Wang, Yi-Xin Huo*. Engineering key amino acid residues of typical pentacyclic triterpene synthases for improving the activity. Appl Microbiol Biotechnol 108, 195 (2024). https://doi.org/10.1007/s00253-024-13030-8 (发表当年影响因子3.9发表年月 2024-02)
[70] Junkai Tuo, Said Nawab, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo. Recent advances in screening amino acid overproducers. Engineering Microbiology, 2023. 3: 100066 (发表年月 2023-01)
[69] Changgeng Xu, Qin Zou, Jiheng Tian, Mengyuan Li, Baowen Xing, Julia Gong, Jiangyun Wang*, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. Simplified Construction of Engineered Bacillus subtilis Host for Improved Expression of Proteins Harboring Noncanonical Amino Acids. ACS Synth Biol. 2023 Feb 17;12(2):583-595. （发表当年影响因子5.249，发表年月2023-02）
[68] Yuhui Du#, Li Li#, Yue Zheng, Jiaheng Liu, Julia Gong, Zekai Qiu, Yanni Li, Jianjun Qiao*, Yi-Xin Huo*. Incorporation of Non-Canonical Amino Acids into Antimicrobial Peptides: Advances, Challenges, and Perspectives. Appl Environ Microbiol. 2022 Dec 13;88(23):e0161722. （发表当年影响因子5.005，发表年月2022-12）
[67] Bo Zheng, Shengzhu Yu, Zhenya Chen* and Yi-Xin Huo*. A consolidated review of commercial-scale high-value products from lignocellulosic biomass. Front Microbiol. 2022 Aug 23;13:933882. （发表当年影响因子5.64，发表年月2022-08）
[66] Hao Guo, Huiyang Wang, Tongtong Chen, Liwei Guo, Lars M Blank, Birgitta E Ebert, Yi-Xin Huo*. Engineering Critical Amino Acid Residues of Lanosterol Synthase to Improve the Production of Triterpenoids in Saccharomyces cerevisiae. ACS Synth Biol. 2022 Aug 19;11(8):2685-2696. （发表当年影响因子5.249，发表年月2022-08）
[65] Liwei Guo, Lichao Sun* and Yi‑Xin Huo. Toward bioproduction of oxo chemicals from C1 feedstocks using isobutyraldehyde as an example. Biotechnol Biofuels Bioprod. 2022 Aug 9;15(1):80. （发表当年影响因子7.67，发表年月2022-08）
[64] Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Using genome and transcriptome analysis to elucidate biosynthetic pathways. Curr Opin Biotechnol. 2022, 75: 102708.（发表当年影响因子10.279，发表年月2022-06）
[63] Tong Wu, Yumei Liu, Jinsheng Liu, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo*. Metabolic engineering and regulation of diol biosynthesis from renewable biomass in Escherichia coli. Biomolecules. 2022, 12:715.（发表当年影响因子6.064，发表年月2022-06）
[62] 刘玉美，毋彤，陈振娅，霍毅欣*。非天然氨基酸及非天然蛋白合成的研究进展。生物加工过程。2022,20(02):182-194. （发表当年影响因子1.109，发表年月2022-06）
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国际/国家专利
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51. 霍毅欣，陈振娅， 毋彤， 张然。对正戊醇绝对特异性响应的BmoR突变体及其应用
50. 霍毅欣，陈振娅，毋彤，张然。对异戊醇绝对特异性响应的BmoR突变体及其应用
49. 霍毅欣, 张然, 陈振娅, 毋彤。对正戊醇特异性响应的BmoR突变体及其应用
48. 霍毅欣, 陈振娅, 张然, 毋彤。对异戊醇特异性响应的BmoR突变体及其应用
47. 霍毅欣, 张然, 陈振娅, 毋彤, 王天鹏。一种对苯乙醇灵敏响应的BmoR突变体生物传感器
46. 孙丽超, 霍毅欣, 范云娟, 郭淑元。一种香兰素生物传感器
45. 霍毅欣, 孙丽超, 范云娟, 郭丽微。一种异丁醛生物传感器及其应用
44. 霍毅欣, 马晓焉, 杨超, 李倚天。一株耐酸的Nissle 1917工程菌 CN118979002A
43. 霍毅欣, 马晓焉, 霍晨曦, 晋李圆。一种提高菌株鲁棒性的抗酸胁迫元件 CN118725056A
42. 霍毅欣, 马晓焉, 霍晨曦, 晋李圆。一种提高菌株鲁棒性的耐盐胁迫元件 CN118702784A
41. 王雨涵, 侯真, 霍毅欣, 陈振娅。一种高产异丁醇的WYH-1菌株 CN118703409A
40. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元。 System and method for screening functional mutants of sgRNA scaffold（一种筛选sgRNA 骨架活性突变体的系统及方法）
39. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元, 野昭晋。一种筛选 Cas9 蛋白突变体的系统及方法
38. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元。一种高通量筛选sgRNA骨架活性突变体的系统及方法 CN118497238A
37. 郭淑元, 孙丽超, 霍毅欣, 夏燕, 董鹏宇。一种 O-甲基转移酶突变体及其在香兰素生产中的应用
36. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元。一种筛选sgRNA骨架活性突变体的系统及方法 CN118853714A
35. 霍毅欣, 卢煜, 曹国强, 孙丽超, 梁泽宇。ENGINEERED MICROORGANISMS AND METHODS FOR BIOLOGICAL PRODUCTION OF AROMATIC AMINO ACID
34. 郭淑元, 孙丽超, 霍毅欣, 夏燕, 董鹏宇, 李佳维。一株高产香兰素的重组枯草芽胞杆菌及其应用
33. 郭淑元, 孙丽超, 霍毅欣, 夏燕, 董鹏宇, 韩钟娆。一株积累香兰素的枯草芽胞杆菌及其应用
32. 霍毅欣, 孙丽超, 郭淑元, 夏燕, 董鹏宇, 李靖。一株耐受香兰素的枯草芽胞杆菌及其应用
31. 霍毅欣, 孙丽超, 郭淑元, 夏燕。一株耐受低pH和高浓度尿素的枯草芽胞杆菌 CN118620810A
30. 霍毅欣, 孙丽超, 郭淑元, 夏燕。一株pH和尿素耐受性提高的枯草芽胞杆菌CN117736949A
29. 霍毅欣, 定婷婷, 陈振娅。一株耐盐济州杆菌及其应用 CN119020189A
28. 金花, 宋威, 刘少波, 霍毅欣, 鲁言明, 朴威兰。去除细胞器基因组污染序列的染色体组装方法及装置 CN115261378A
27. 郑泽慧, 郭凯, 王庆玲, 田志喜, 任宗明, 霍毅欣, 刘书林, 黄艳华, 李哲, 郝永任。一株大豆根瘤菌及其应用 CN114480171B 授权
26. 霍毅欣, 马晓焉, 郭昊, 孙丽超。一种适用于筛选高产天然氨基酸的菌株的方法 CN116376946A
25. 霍毅欣, 马晓焉, 郭昊, 孙丽超。一种适用于筛选高产非蛋白质氨基酸的菌株的方法 CN116376947A
24. 霍毅欣, 孙丽超, 郭丽微, 马晓焉。一种提升氨基酸胁迫条件下菌株性能的代谢工程方法 CN116103325A
23. 霍毅欣, 孙丽超, 郭丽微, 马晓焉。一种筛选氨基酸高产菌株和氨基酸合成途径酶的方法 CN116103361A
22. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。一种基于BmoR突变体的宽域生物传感器 CN116023447A
21. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。对异丁醇特异性响应的BmoR突变体及其应用 CN115991746A
20. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。一种基于BmoR突变体的高灵敏生物传感器 CN115991747A
19. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。一种基于BmoR突变体的高敏感性的生物传感器 CN115991748A
18. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。对正丁醇特异性响应的BmoR蛋白突变体及其应用 CN115160415A 已授权
17. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。对乙醇不敏感对正丁醇特异性响应的BmoR蛋白突变体 CN115181168A已授权
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主讲课程
1. 《分子生物学》 本科生课程
2. 《生命科学基础》 本科生和研究生课程
3. 《现代分子生物学》 研究生课程
4. 《（英）现代生命科学与生物技术述评》 研究生课程
5. 《绿色合成与智能制造研究生》 研究生课程
主要教学成果
1. 《图解现代生物技术前沿》(ISBN : 978-7-5682-8031-0)，主编，北京理工大学出版社
2. 《生命科学基础》，副主编，负责6万字，高教出版社
3. 《合成生物学》，编委，负责1.6万字，化工出版社
4. 《Engineering Microbial Metabolism for Chemical Synthesis》，编者，负责1万字（总数7万字），World Scientific
5. 基于学科交叉实施生物科学通识教育教学模式改革（教改论文），2023，孙丽超，马晓焉，陈振娅，邹沁，霍毅欣，通讯作者，已录用
6. 基于读图的生物学专业能力考核改革与实践（教改论文），生物学杂志，2022. 39(06): p. 117-121，马晓焉, 陈振娅, 霍毅欣，通讯作者
7. 基于科学前沿的“一体式”微生物学开放实验课程探索（教改论文），生物学杂志，2022.39(03): p. 111-115，陈振娅，马晓焉，霍毅欣，通讯作者
8. 高站位与培养细节并重，精心培育研究生的创新能力，优秀教育教学成果奖，赵东旭，罗爱芹，霍毅欣，王丰，黄渊余
9. 北京理工大学第十三届青年教师教学基本功比赛，校级一等奖，孙丽超
10. 2020年北京市优秀本科毕业论文，优秀指导教师，霍毅欣
11. 2022年北京理工大学优秀硕士学位论文，优秀指导教师，霍毅欣
12. 2022年北京理工大学优秀博士学位论文，优秀指导教师，霍毅欣
13. 2022届北京理工大学本科生毕业设计（论文）重点项目，优秀指导教师，霍毅欣
14. 第七届北京市大学生生物学竞赛，北京市三等奖，霍毅欣
15. 第八届北京市大学生生物学竞赛，北京市三等奖，霍毅欣
16. 第九届北京市大学生生物学竞赛，北京市三等奖，霍毅欣，孙丽超
17. “青创北京”2023年“挑战杯”首都大学生课外学术科技作品竞赛“黑科技”专项赛，北京市一等奖，霍毅欣，孙丽超，陈振娅
18. 中国国际大学生创新大赛(2024)，北京赛区三等奖，霍毅欣，陈振娅，孙丽超，邹沁，马晓焉
19. “青创北京”2024年“挑战杯”首都大学生创业计划竞赛，北京市金奖，霍毅欣，陈振娅，孙丽超，邹沁，马晓焉
20. 第十四届“挑战杯”秦创原中国大学生创业计划竞赛（2024年），全国金奖，指导教师：霍毅欣，陈振娅，孙丽超，邹沁，马晓焉
21. 生命科学基础课群，获批聚能课程，霍毅欣等人
22. 延根赓续、自力更“生” ——大国博弈背景下的我国生物学创新人才培养实践，获北京理工大学教育教学成果二等奖，霍毅欣等人
学科建设
现任北京理工大学生命学院副院长（分管研究生招生与培养）、生物工程专业责任教授、生物技术专业责任教授、工业和信息化部“分子医学与生物诊疗”重点实验室副主任。在2018年作为“生物化学与分子生物学”的学科方向带头人助力北京理工大学生命学院成功获批生物学一级学科博士点。作为责任教授获批生物技术专业的北京市一流专业。
人才培养
四名博士后入职北京理工大学、华南理工大学和中国科学院等科研院所，培养的博士研究生郑博、郭丽微入选CSC项目。四名本科生在本实验室完成毕业设计并被评为优秀等级，四名本科生获得北京理工大学优秀毕业生。一名本科生（孟祥瑜）获北京市优秀毕业论文。刘玉美、张姣、赵璐瑶三名硕士生论文被评为北京理工大学优秀毕业论文，两名硕士生获得北京理工大学优秀毕业生。郑博、于盛竹两名博士生论文被评为北京理工大学优秀毕业论文。夏燕、梁泽宇、郑博、黄潮勇获得博士生国家奖学金，赵璐瑶、梁昕鑫获得硕士国家奖学金，张鹏程、马炼杰等多名毕设本科生获得国家奖学金，郑博获工信部创新创业奖学金等省部级奖学金。王雨涵、侯真等获得挑战杯国赛金奖，王雨涵等获得两次北京市挑战杯金奖，十余人次的研究生获得世纪杯等校级竞赛荣誉。十一名硕士生进入高校或科研院所攻读博士学位。
科学研究
一直致力于解决绿色生物制造的关键基础科学与技术问题，围绕“天然资源的微生物精炼与制造”，以合成生物学为核心，以“人工细胞工厂的设计-构建-筛选-放大”为主线，以多种模式生物为研究对象，取得了一系列科研成果。入职北理工以来共发表高水平论文80余篇，代表作被收录于Nat Commun、Cell Reports、Nucleic Acids Res、Metab Eng、Engineering等权威期刊。入职北理工前5篇代表作发表于Science、Nat Biotechnol、Nucleic Acids Res和Curr Opin Biotech。申请二十余项国际、国内专利，其中3项美国专利和多个国内专利已授权。主持十余项自然国家重点研发计划课题、科学基金委面上项目、国防科技创新特区等国家、省部及地区级项目。
公共服务
现任中国生物工程学会理事、中国生物工程学会青年工作委员会副主任、中国化工学会生物化工青年学者工作委员会常务委员、中国生物工程学会氨基酸专业委员会委员、美国化工学会（AICHE）资深会员和美国生物化学学会（ASBMB）会员等。曾担任国家级（青年）项目的会评专家、教育部长江学者、国家自然科学基金委面上及青年项目的函评专家等。曾担任美国化学年会的分会主席。担任农工民主党北京理工大学支部副主委。
教育教学
在北理工任教期间，主讲7门本科生课程，4门研究生课程。课程内容较为全面，涵盖生命科学基础、生物工程与技术导论、（英）现代生命科学与技术述评、分子生物学、生物化学等基础课程，也有国内外生物/医药类创业企业的最新成功及失败案例、绿色合成与智能制造等产业化分析课程，以及合成生物学等专业课程。同时积极参加教育教学改革项目，发表两篇教改论文：马晓焉，陈振娅，霍毅欣，基于读图的生物学专业能力考查；陈振娅，马晓焉，霍毅欣，基于科学前沿的“一体式”微生物学开放实验课程探索。
求才若渴
团队常年招收海内外在合成生物学、代谢工程、酶工程、生物信息学等领域的有志之士
招收岗位：教授/研究员、副教授/副研究员、助理教授、博士后、博士生、硕士生
薪酬待遇：参考北京理工大学相应岗位聘用待遇薪酬
联系方式：手机/微信：18910254522，邮箱：huoyixin@bit.edu.cn