智慧生物学系
霍毅欣 教授 / 博士生导师
北京理工大学特聘教授（二级）、生命学院副院长
博士生导师（生物医学工程、生物学）
北京理工大学第十届校学术委员会委员
北京理工大学第十二届校学位委员会委员
北京理工大学第四届理材学部委员
分子医学与生物诊疗工业和信息化部重点实验室副主任
学科专业责任教授（生物学学科、生物技术本科专业）
国家级领军人才（2022年入选）
国家级青年人才（2015年入选）、江苏省双创人才（2015年入选）
中国生物工程学会理事、青年工作委员会委员
农工民主党中央教育科技工作专委会委员、农工民主党北京理工大学支部主委
2024年第十四届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛主赛道金奖指导教师
邮箱：huoyixin@bit.edu.cn电话：18910254522
教育经历
2008-08至2011-07，加州大学洛杉矶分校，博士后，导师：James C. Liao教授（美国科学院院士、美国工程院院士、美国国家发明家科学院院士，第三世界科学院院士、台湾中央研究院院士、现任台湾中央研究院院长）
2006-05至2008-08，加州大学洛杉矶分校，博士后，导师：Jay D. Gralla教授
2002-09至2005-12，巴黎第七大学，分子微生物学及病毒学，博士（联合培养、分别获得中法两国博士学位），导师：Annie Kolb研究员
2000-09至2005-12，北京大学，生物化学及分子生物学，博士，导师：王忆平教授
1995-09至1999-06，南开大学，微生物学，学士
科研与学术工作经历
2025年5月至今，北京理工大学，第十届校学术委员会委员
2025年5月至今，北京理工大学，第十二届校学位委员会委员
2024年7月至今，北京理工大学，生命学院，副院长（分管研究生、本科教学）
2023年8月至今，北京理工大学，生命学院，特聘教授（二级教授）
2023年4月至今，北京理工大学，第四届理材学部委员
2021-01至2023年8月，北京理工大学，生命学院，长聘教授（三级教授）
2019-10至2024年7月，北京理工大学，生命学院，副院长（分管研究生、学科建设）
2019-09至今，北京理工大学，生命学院，生物技术专业责任教授
2019-01至今，北京理工大学，工业和信息化部“分子医学与生物诊疗”重点实验室，副主任
2017-09至2020-12，北京理工大学，生命学院，生物工程专业责任教授
2015-09至2020-12，北京理工大学，生命学院，教授
2014-11至2015-09，加州大学洛杉矶分校苏州先进技术研究院，生物能源研究中心，实验室主任（兼）
2011-08至2015-09，Nantworks集团Easel生物技术公司，项目主管、资深研究员
研究方向
生物信息学：基于深度学习和大语言模型的DNA和酶设计；微生物进化机制
生物医学工程：药物中间体的微生物合成途径构建及高效生产；生物传感器的研发；肠道微生物和哺乳动物细胞的基因编辑
合成生物学（碳中和）：二氧化碳资源化；高鲁棒性底盘宿主构建；塑料降解
课题组成员：马晓焉特别研究员、陈振娅特别研究员、孙丽超特别副研究员、邹沁特别副研究员
校内合作团队：郭淑元教授、邵斌教授、金花教授
代表性教学成果：
1. 第十四届“挑战杯”秦创原中国大学生创业计划竞赛（2024年），全国金奖，指导教师：霍毅欣、陈振娅、孙丽超、邹沁、马晓焉
2. “青创北京”2024年“挑战杯”首都大学生创业计划竞赛，北京市金奖，指导教师：霍毅欣、陈振娅、孙丽超、邹沁、马晓焉
3. “青创北京”2023年“挑战杯”首都大学生课外学术科技作品竞赛“黑科技”专项赛，北京市一等奖，指导教师：霍毅欣、孙丽超、陈振娅
4. 2020年北京市优秀本科毕业论文指导教师，霍毅欣
5. 延根赓续、自力更“生” ——大国博弈背景下的我国生物学创新人才培养实践，获北京理工大学教育教学成果二等奖，霍毅欣、马晓焉、郭淑元、陈振娅、周连景、孙丽超、邹沁、安宜、张桔
纵向科研项目:
15、科学技术部国家重点研发计划，合成生物学专项，基因密码子扩展技术及功能蛋白定向改造，课题一：原核生物中高效基因密码子拓展系统的构建及应用（课题负责人，500万），2024/12-2029/11，主持
14、国家自然科学基金委员会，面上项目，32371489，半理性设计RNA聚合酶提高微生物细胞工厂生产性能，2024/01-2027/12，50万，主持
13、科学技术部国家重点研发计划，合成生物学专项，2019YFA0904104，非天然氨基酸生物合成及其适配底盘的设计及应用，2020/01-2024/12，536万元，在研，主持（课题负责人，为项目2019YFA0904100的课题四）
12、科学技术部国家重点研发计划，绿色生物制造专项，2021YFC2100500，高效微生物细胞工厂的设计原理与构建方法，2021/07-2024/06，在研，子课题负责人
11、国家自然科学基金委员会国际合作项目，31961133014，塑料解聚及资源化微生物菌群的人工构建，2020/01-2023/12，在研，参与
10、济南市“高校20条”资助项目，发酵废弃物的微生物高值转化，2019/12-2021/12，已结题，主持
9、北京理工大学科技创新计划，二氧化碳的微生物固定，2019/01-2021/12，已结题，主持
8、国家自然科学基金委员会重点项目，21736002，微生物合成萜烯化合物过程中的跨膜转运与代谢传质强化，2018/01-2022/12，在研，参加
7、科学技术部国家重点研发计划，2017YFD0201400，天然绿色生物农药的合成生物学与组合合成技术，2017/01-2021/06，已结题，子课题负责人
6、国家自然科学基金委员会，面上项目，21676026，α-香树酯醇的酶法异构机理及其微生物合成，2017/01-2020/12，已结题，主持
5、江苏省双创人才，2016/01-2018/12，已结题，主持
4、国家级青年人才项目，2016/07-2018/06，已结题，主持
3、北京理工大学优秀青年教师资助计划，利用微生物实现二氧化碳的资源化，2016/07-2018/06，已结题，主持
2.Bio-Oxo Technologies, Awarded by Department of Energy (DOE), No. DE-EE0005773, 2014/12-2016/12, Total: 2.5 millions US dollars, 主持
1.Electro-Autotrophic Synthesis of Higher Alcohols, Awarded by Department of Energy (DOE), No. AR0000085, PI: James Liao (UCLA), Year 2010-2014, Total: 4 million US dollars, Co-PI（共同主持）
文章列表
[100]Yan Xia, Zeyu Liang, Xiaowen Du, Dengtian Cao, Jing Li, Lichao Sun, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, Design nonrepetitive and diverse activity single-guide RNA by deep learning, 2025. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. (in press) （接收当年影响因子7.7, 接收日期2025年7月）
[99] Shanshan Liu, Nanlin Hu, Jiawang Hu, Wenting Li, Shikai Wu, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*, Yuan Lu*. DNA-Mediated Bioinspired MXene Gas Sensor Array with Machine Learning for Noninvasive Cancer Recognition. ACS Nano. 2025 Jul 15;19(27):25363-25384. doi: 10.1021/acsnano.5c06893. Epub 2025 Jun 28.（发表当年影响因子16.0, 发表日期2025年7月）
[98] Min Li, Zhenya Chen*, Wuyuan Zhang, Tong Wu, Qingsheng Qi, Yi-Xin Huo*.Customization of Ethylene Glycol (EG)-Induced BmoR-Based Biosensor for the Directed Evolution of PET Degrading Enzymes. Adv Sci (Weinh). 2025 Apr;12(13):e2413205. doi: 10.1002/advs.202413205. Epub 2025 Feb 10.（发表当年影响因子14.1, 发表日期2025年2月）
[97] Wenting Li, Yiming Wang, Chen Wang, Yi-Xin Huo*, Yuan Lu*. Comparative Function Analysis of Self-Amplifying mRNA and Self-Amplifying DNA. Chembiochem. 2025 Jul 11;26(13):e202500110. doi: 10.1002/cbic.202500110. Epub 2025 Jun 17. PMID: 40444880.（发表当年影响因子2.8, 发表日期2025年7月）
[96] Zeyu Liang #, Chaoyong Huang #, Yitian Li, Chao Yang, Ning Wang*, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo. A recombineering-based platform for high-throughput genomic editing in Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 2025 Jun 12:e0019325. doi: 10.1128/aem.00193-25. Epub ahead of print. PMID: 40503884.（发表当年影响因子3.7, 发表日期2025年6月）
[95] Yan Xia, Lichao Sun, Zeyu Liang, Zhongrao Han, Jing Li, Pengyu Dong, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. Chromosome-segment scanning for gain- or loss-of-function screening (CHASING).iScience. 2025 Apr 17;28(5):112484. doi: 10.1016/j.isci.2025.112484. （发表当年影响因子4.1, 发表日期2025年5月）
[94] Zeyu Liang, Xin Wu, Zhaojin Ye, Lingwei She, Xiaoyan Ma, Yi-Xin Huo*. Protocol for identification of sgRNA mutants using high-throughput screening technique and multiplex genome editing. STAR Protoc. 2025 Jun 20;6(2):103690. doi: 10.1016/j.xpro.2025.103690. Epub 2025 Mar 23.（发表当年影响因子1.3, 发表日期2025年3月）
[93] Zeyu Liang, Zhaojin Ye, Yan Xia, Xiaowen Du, Lichao Sun, Xiaoyan Ma, Shuyuan Guo*, Yi-Xin Huo*. One-round-per-day CRISPR genome editing of E. coli for engineering green-chemical overproducer. Chemical Engineering Journal. Volume 503, 1 January 2025, 158453. https://doi.org/10.1016/j.cej.2024.158453.（发表当年影响因子13.2, 发表日期2025年1月）
[92] Tong Wu, Dongli Yan, Sheng Lin, Ran Zhang, Yuhan Wang, Min Lin, Shengzhu Yu, Xiaoyan Ma, Zhenya Chen*, Yi-XinHuo*. Machine-Learning aided design of BmoR biosensors with strict higher-alcohol specificity for biofuel overproduction. 2024. (under review)
[91] Yan Xia, Jinyuan Sun, Xiaowen Du, Zeyu Liang, Wenyu Shi, Shuyuan Guo*, Yi-Xin Huo*. Language model generates cis-regulatory elements across prokaryotes. BioRxiv.doi: https://doi.org/10.1101/2024.11.07.622410. 2024. (under review)
[90]ChenxiHuo, Lianjie Ma, Ping Liu, Liyuan Jin, Dongli Yan, Zekun Yu, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. Unveiling the differentiated stress-adaptation-induced mutation hotspots in bacterial transcription machinery evolved under natural and laboratory conditions. 2024. (underreview)
[89]Lianjie Ma, ChenxiHuo, Zekun Yu, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. Reassigning core RNA polymerase to different sigma factors through mutations in interaction domains. 2024. (under review)
[88]Yan Xia, Xiaowen Du, Zeyu Liang, Zhaojin Ye, Dengtian Cao, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, CRISPR-Cas9/SpRY-mediated rapid and universal genome editing in Bacillus subtilis, 2024. (underreview)
[87] Min Li, Zhenya Chen*, and Yi-Xin Huo*.Application Evaluation and Performance-Directed Improvement of the Native and Engineered Biosensors.ACS Sensors 2024 9 (10), 5002-5024. DOI: 10.1021/acssensors.4c01072（发表当年影响因子8.2, 发表日期2024年10月）
[86]Pengyu Dong, Yunjuan Fan, Yi-Xin Huo, Lichao Sun*, Shuyuan Guo*, A pathway-adapted biosensor for high-throughput screening of O-methyltransferase and its application in vanillin synthesis. ACS Synthetic Biology, 2024. https://doi.org/10.1021/acssynbio.4c00287.（发表当年影响因子3.7，发表日期2024年9月）
[85]Yingjie Guo, Yan Xia, Zeyu Liang, Shenyan Yang, Shuyuan Guo, Lichao Sun*, Yi-Xin Huo*, Plasmid-stabilizing strains for antibiotic-free chemical fermentation. ACS Synthetic Biology, 2024. https://doi.org/10.1021/acssynbio.4c00241.（发表当年影响因子3.7，发表日期2024年8月）
[84]Jiawei Li#, Jiunwei Tseng#, Dan Tang, YunqianYonga, Lichao Sun*, Yi-Xin Huo*, Upcycling C1 gas-derived resources in future food system. Resources, Conservation & Recycling, 2024, 210: 107827. https://doi.org/10.1016/j.resconrec.2024.107827.（发表当年影响因子11.2，发表日期2024年11月）
[83]孙丽超, 赵鹏卓,胡伟, 霍毅欣*, 空间微生物研究及其航天应用. 生物学杂志, 2024, Vol. 41, Issue (6): 1-.doi: 10.3969/j.issn.2095-1736.2024.06.001.
[82] Wei Song, Chong Li, Yanming Lu, Dawei Shen, Yunxiao Jia, YixinHuo, Weilan Piao, Hua Jin.Chlomito: a novel tool for precise elimination of organelle genome contamination from nuclear genome assembly.Front Plant Sci. 2024 Aug 27:15:1430443. doi: 10.3389/fpls.2024.1430443. eCollection 2024. (发表当年影响因子4.8，发表日期2024年8月)
[81]Yan Xia, Xiaowen Du, Bin Liu, Shuyuan Guo*, Yi-Xin Huo*. Species-specific design of artificial promoters by transfer-learning based generative deep-learning model. Nucleic Acids Research. 2024 May 23:gkae429. doi: 10.1093/nar/gkae429. Online ahead of print. （发表当年影响因子16.6，发表日期2024年6月）
针对非模式生物启动子训练数据集不足的问题，用迁移学习大模型实现对27种原核生物的物种特异性启动子的生成。
[80]Tingting Ding, Zeyu Liang, Yu Yang, Jing Liu, Wenting Li, Yuhui Du, Zhenya Chen, Yi-Xin Huo*. Rapidly engineering an osmotic-pressure-tolerant gut bacterium for efficient non-sterile production of bulk chemicals. Chemical Engineering Journal. 2024 July 1. doi.org/10.1016/j.cej.2024.152076. （发表当年影响因子13.3，发表日期2024年7月）
从昆虫肠道中分离出来一种耐盐底盘菌株并建立全套基因编辑方法，可以高盐、非灭菌、非粮底物高效生产大宗化学品。
[79]Zeyu Liang, Chaoyong Huang, Yan Xia, Zhaojin Ye, Shunhua Fan, Junwei Zeng, Shuyuan Guo, Xiaoyan Ma, Lichao Sun, Yi-Xin Huo*. Identification of functional sgRNA mutants lacking canonical secondary structure using high-throughput FACS screening. Cell Reports. 2024 May 31;43(6):114290. doi: 10.1016/j.celrep.2024.114290. Online ahead of print. （发表当年影响因子8.8，发表日期2024年6月）
筛选到2000余种完全失去经典二级结构的、序列高度变异的（up to 80%序列不同）、有（完全）活性的sgRNA，用于克服基因编辑中的重组和脱靶问题。
[78]Zhenya Chen, Shengzhu Yu, Jing Liu, Liwei Guo, Tong Wu, Peifeng Duan, Dongli Yan, Chaoyong Huang, Yi-Xin Huo*. Concentration Recognition-Based Auto-Dynamic Regulation System (CRUISE) Enabling Efficient Production of Higher Alcohols. Advanced Science. 2024 Apr 16:e2310215. doi: 10.1002/advs.202310215. （发表当年影响因子15.1，发表日期2024年4月）
在氨基酸衍生物生产过程中实现胞内氨基酸浓度的动态调控，克服其因转化造成的浓度不足对底盘细胞的生长抑制问题。
[77] Zeyu Liang, Zhaojin Ye, Yan Xia, Xiaowen Du, Shunhua Fan, LiChao Sun, ShuYuan Guo* Yi-Xin Huo*. Low-cost and rapid construction of green energy overproducers based on the CRISPR system. 2024. Chemical Engineering Journal. （发表当年影响因子13.3，接收日期2024-12）
[76] HaojieJin, Jiaqi Zhang, Yan Wang, Wanzhao Ge, Yike Jing, Xiaoyu Cao, YixinHuo, Yujie Fu*,A codon-based live-cell biomonitoring system for assessing intracellular phenylalanine bioavailability in cyanobacteria, Biosensors and Bioelectronics, 2024,115792. DOI: 10.1016/j.bios.2023.115792. (影响因子10.7，发表年月 2024-01)
[75] Ying Liu, Lichao Sun*, Yi-Xin Huo, Shuyuan Guo*, Strategies for improving the production of bio-based vanillin, Microbial Cell Factories, 2023, 22(1):147. DOI: 10.1186/s12934-023-02144-9. (影响因子6.4，发表年月 2023-08)
[74] Zhenya Chen, Tong Wu, Shengzhu Yu, Min Li, Xuanhe Fan, Yi-Xin Huo*. Self-assembly systems to troubleshoot metabolic engineering challenges. Trends in Biotechnology. 2024, 42(1):43-60.（发表当年影响因子14.3，发表年月 2024-01）
[73] Yan Xia#, Lichao Sun#, Zeyu Liang, Yingjie Guo, Jing Li, Dan Tang, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*, The construction of a PAM-less base editing toolbox in Bacillus subtilis and its application in metabolic engineering, Chemical Engineering Journal, 2023, 469:143865. DOI: 10.1016/j.cej.2023.143865 (发表当年影响因子16.744，发表年月 2023-05)
[72] Hao Guo#, Ning Wang#, Tingting Ding, Bo Zheng, Liwei Guo, Chaoyong Huang, Wuyuan Zhang, Lichao Sun, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. A tRNA Modification-based strategy for Identifying amiNo acid Overproducers (AMINO). Metab Eng. 2023. 78: 11-25 (发表当年影响因子8.4，发表年月 2023-07)
[71] Hao Guo, Tongtong Chen, Hanrong Zhu, Huiyan Wang, Yi-Xin Huo*. Engineering key amino acid residues of typical pentacyclic triterpene synthases for improving the activity. Appl Microbiol Biotechnol 108, 195 (2024). https://doi.org/10.1007/s00253-024-13030-8 (发表当年影响因子3.9发表年月 2024-02)
[70] JunkaiTuo, Said Nawab, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo. Recent advances in screening amino acid overproducers. Engineering Microbiology, 2023. 3: 100066 (发表年月 2023-01)
[69] Changgeng Xu, Qin Zou, Jiheng Tian, Mengyuan Li, Baowen Xing, Julia Gong, Jiangyun Wang*, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. Simplified Construction of Engineered Bacillus subtilis Host for Improved Expression of Proteins Harboring Noncanonical Amino Acids. ACS Synth Biol. 2023 Feb 17;12(2):583-595. （发表当年影响因子5.249，发表年月2023-02）
[68] Yuhui Du#, Li Li#, Yue Zheng, Jiaheng Liu, Julia Gong, ZekaiQiu, Yanni Li, JianjunQiao*, Yi-Xin Huo*. Incorporation of Non-Canonical Amino Acids into Antimicrobial Peptides: Advances, Challenges, and Perspectives. Appl Environ Microbiol. 2022 Dec 13;88(23):e0161722. （发表当年影响因子5.005，发表年月2022-12）
[67] Bo Zheng, Shengzhu Yu, Zhenya Chen* and Yi-Xin Huo*. A consolidated review of commercial-scale high-value products from lignocellulosic biomass. Front Microbiol. 2022 Aug 23;13:933882. （发表当年影响因子5.64，发表年月2022-08）
[66] Hao Guo, Huiyang Wang, Tongtong Chen, Liwei Guo, Lars M Blank, Birgitta E Ebert, Yi-Xin Huo*. Engineering Critical Amino Acid Residues of Lanosterol Synthase to Improve the Production of Triterpenoids in Saccharomyces cerevisiae. ACS Synth Biol. 2022 Aug 19;11(8):2685-2696. （发表当年影响因子5.249，发表年月2022-08）
[65] Liwei Guo, Lichao Sun* and Yi‑Xin Huo. Toward bioproduction of oxo chemicals from C1 feedstocks using isobutyraldehyde as an example. Biotechnol Biofuels Bioprod. 2022 Aug 9;15(1):80. （发表当年影响因子7.67，发表年月2022-08）
[64] Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Using genome and transcriptome analysis to elucidate biosynthetic pathways. CurrOpinBiotechnol. 2022, 75: 102708.（发表当年影响因子10.279，发表年月2022-06）
[63] Tong Wu, Yumei Liu, Jinsheng Liu, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo*. Metabolic engineering and regulation of diol biosynthesis from renewable biomass in Escherichia coli. Biomolecules. 2022, 12:715.（发表当年影响因子6.064，发表年月2022-06）
[62] 刘玉美，毋彤，陈振娅，霍毅欣*。非天然氨基酸及非天然蛋白合成的研究进展。生物加工过程。2022,20(02):182-194. （发表当年影响因子1.109，发表年月2022-06）
[61] Zhenya Chen, Tongtong Chen, Shengzhu Yu, Yi-Xin Huo*. A high-throughput visual screening method for p-hydroxybenzoate hydroxylase to increase phenolic compounds biosynthesis. Biotechnol Biofuels Bioprod .2022, 15:43.（发表当年影响因子7.67，发表年月2022-05）
[60] Mengyuan Li, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. CRISPR-Mediated Base Editing: From Precise Point Mutation to Genome-Wide Engineering in Nonmodel Microbes. Biology-Basel. 2022, 11(4): 571.（发表当年影响因子5.007，发表年月2022-04）
[59] Jiheng Tian, Baowen Xing, Mengyuan Li, Changgeng Xu, Yi-Xin Huo*, Shuyuan Guo*. Efficient Large-Scale and Scarless Genome Engineering Enables the Construction and Screening of Bacillus subtilis Biofuel Overproducers. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 4853.（发表当年影响因子5.923，发表年月2022-04）
[58] Yuhui Du, Wei Song, Zhiqiu Yin, Shengbo Wu, Jiaheng Liu, Ning Wang, Hua Jin, JianjunQiao, Yi-Xin Huo*. Genomic Analysis Based on Chromosome-Level Genome Assembly Reveals an Expansion of Terpene Biosynthesis of Azadirachta indica. Front Plant Sci. 2022, 13: 853861.（发表当年影响因子5.753，发表年月2022-04）
[57] Bo Zheng, Yinchao He, Pengxiang Zhang, Yi-Xin Huo, Yanbin Yin*. Polyphenol Utilization Proteins in the Human Gut Microbiome. Appl Environ Microbiol. 2022 Feb 8;88(3):e0185121.（发表当年影响因子5.005，发表年月2022-02）
[56] Tong Wu#, Zhenya Chen#, Shuyuan Guo, Cuiying Zhang, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR mutants for constructing multifunctional alcohol biosensors. ACS Synth Biol. 2022, 11(3): 1251-1260（发表当年影响因子5.249，发表年月2022-02）
[55] Shengzhu Yu, Bo Zheng, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo. Metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum for producing branched chain amino acids. Microb Cell Fact. 2021. 20(1): 1-14（发表当年影响因子6.352，发表年月2021-12）
[54] Luyao Zhao, Zhenya Chen, Sheng Lin, Tong Wu, Shengzhu Yu, Yi-Xin Huo*. In Vitro Biosynthesis of Isobutyraldehyde Through the Establishment of a One-Step Self-Assembly-Based Immobilization Strategy. J Agr Food Chem. 2021. 69(48): 14609-19（发表当年影响因子5.279，发表年月2021-11）
[53] Huiyan Wang#, Hao Guo#, Ning Wang*, Yi-Xin Huo*. Toward the Heterologous Biosynthesis of Plant Natural Products: Gene Discovery and Characterization. ACS Synth Biol. 2021（发表当年影响因子5.249，发表年月2021-11）
[52] Xiaoyan Ma#, Lianjie Ma#, Yi-Xin Huo*. Reconstructing the transcription regulatory network to optimize resource allocation for robust biosynthesis. Trends Biotechnol. 2021（发表当年影响因子21.932，发表年月2021-11）
[51] 马晓焉，王雪芹，马炼杰，霍毅欣*。高级醇的微生物绿色制造。生物工程学报。2021. 37(05): 1721-36（发表当年影响因子0.977，发表年月2021-05）
[50] Jingge Wang#, Chaoyong Huang#, Kai Guo, Lianjie Ma, Xiangyu Meng, Ning Wang*, Yi-Xin Huo*. Converting Escherichia coli MG1655 into a chemical overproducer through inactivating defense system against exogenous DNA. Syn Syst Biotechno. 2020. 5(4): 333-42（发表当年影响因子4.781，发表年月2020-12）
[49] Huiyan Wang, Ning Wang*, Yi-Xin Huo*. Multi-tissue transcriptome analysis using hybrid-sequencing reveals potential genes and biological pathways associated with azadirachtin A biosynthesis in neem (azadirachta indica). BMC Genomics. 2020. 21(1): 1-17（发表当年影响因子3.969，发表年月2020-10）
[48] Mengli Xia, Lin Hu, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Myroides albus sp. nov., isolated from the gut of plastic-eating larvae of the coleopteran insect Zophobasatratus. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(10): 5460-6（发表当年影响因子2.747，发表年月2020-09）
[47] Ziyu Xu, Mengli Xia, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Intestinirhabdus alba gen. nov., sp. nov., a novel genus of the family Enterobacteriaceae, isolated from the gut of plastic-eating larvae of the Coleoptera insect Zophobasatratus. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(9): 4951-9（发表当年影响因子2.747，发表年月2020-09）
[46] Chaoyong Huang#, Liwei Guo#, Jingge Wang, Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Efficient long fragment editing technique enables large-scale and scarless bacterial genome engineering. Appl Microbiol Biotechnol. 2020. 104(18): 7943-56（发表当年影响因子4.813，发表年月2020-08）
[45] Hao Guo, Huiyan Wang, Yi-Xin Huo*. Engineering critical enzymes and pathways for improved triterpenoid biosynthesis in yeast. ACS Synth Biol. 2020. 9(9): 2214-27（发表当年影响因子5.249，发表年月2020-08）
[44] 梁昕鑫，唐丹，霍毅欣*。蛋白源生物质的绿色生物转化。生物技术通报。2020. 36(12): 216（发表当年影响因子0.986，发表年月2020-07）
[43] Shengzhu Yu, Liwei Guo, Luyao Zhao, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo*. Metabolic engineering of E. coli for producing phloroglucinol from acetate. Appl Microbiol Biotechnol. 2020. 104(18): 7787-99（发表当年影响因子4.813，发表年月2020-07）
[42] Xiaoyan Ma, Lianjie Ma, Yi-Xin Huo*, Harnessing the hierarchy of transcriptional regulation: engineering of the gene expression network for efficient production, in Systems and Synthetic Metabolic Engineering. 2020, Elsevier. p. 107-24. （发表年月2020-07）
[41] Zhiqiu Yin, Jiaheng Liu, Binghai Du, Hai-Hua Ruan, Yi-Xin Huo*, Yuhui Du*, JianjunQiao*. Whole-Genome-Based survey for polyphyletic serovars of Salmonella enterica subsp. enterica provides new insights into public health surveillance. Int J Mol Sci. 2020. 21(15): 5226（发表当年影响因子5.924，发表年月2020-07）
[40] Jiakang Ru, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Microbial degradation and valorization of plastic wastes. Front Microbiol. 2020. 11: 442（发表当年影响因子5.64，发表年月2020-04）
[39] Said Nawab, Ning Wang*, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo. Genetic engineering of non-native hosts for 1-butanol production and its challenges: a review. Microb Cell Fact. 2020. 19(1): 1-16（发表当年影响因子6.352，发表年月2020-03）
[38] Tingting Ding, Chaoyong Huang, Zeyu Liang, Xiaoyan Ma*, Ning Wang*, Yi-Xin Huo. Reversed paired-gRNA plasmid cloning strategy for efficient genome editing in Escherichia coli. Microb Cell Fact. 2020. 19(1): 1-13（发表当年影响因子6.352，发表年月2020-03）
[37] Mengli Xia, Jialei Wang, Yi-Xin Huo, Yu Yang*. Mixtatenebrionis sp. nov., isolated from the gut of the plastic-eating mealworm Tenebrio molitor L. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(2): 790-6（发表当年影响因子2.747，发表年月2020-02）
[36] Lianjie Ma#, Liwei Guo#, Yunpeng Yang, Kai Guo, Yajun Yan, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo. Protein-based biorefining driven by nitrogen-responsive transcriptional machinery. Biotechnol Biofuels Bioprod. 2020. 13(1): 1-14（发表当年影响因子6.04，发表年月2020-02）
[35] Huan Yu#, Zhenya Chen#, Ning Wang, Shengzhu Yu, Yajun Yan, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR for screening butanol overproducers. Metab Eng. 2019. 56: 28-38（发表当年影响因子9.783，发表年月2019-12）
[34] Chaoyong Huang, Tingting Ding, Jingge Wang, Xueqin Wang, Liwei Guo, Jialei Wang, Lin Zhu, Changhao Bi, Xueli Zhang, Xiaoyan Ma, Yi-Xin Huo*. CRISPR-Cas9-assisted native end-joining editing offers a simple strategy for efficient genetic engineering in Escherichia coli. Appl Microbiol Biotechnol. 2019. 103(20): 8497-509（发表当年影响因子4.813，发表年月2019-10）
[33] Liyuan Jin#, Said Nawab#, Mengli Xia, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. Context‐dependency of synthetic minimal promoters in driving gene expression: a case study. MicrobBiotechnol. 2019. 12(6): 1476-86（发表当年影响因子5.813，发表年月2019-10）
[32] 杨云彭，马晓焉，霍毅欣*。密码子优化策略在异源蛋白表达中的应用。生物工程学报。2019. 35(12): 2227-37（发表当年影响因子0.977，发表年月2019-09）
[31] 郑博，王宁*，霍毅欣。基于转录和翻译调控的氨基酸高产菌株筛选及构建策略。生物技术通报。2020. 36(4): 34（发表当年影响因子0.986，发表年月2019-09）
[30] Xiaoyan Ma#, Xinxin Liang#, Yi-Xin Huo*. Developing a transformation-independent and unbiased qPCR assay to rapidly evaluate the determinants of DNA assembly efficiency. Engineering. 2019. 5(4): 803-10（发表当年影响因子7.553，发表年月2019-08）
[29] Zhenya Chen#, Luyao Zhao#, Jiakang Ru, Shengzhu Yu, Huan Yu, Huiyong Ren, Yuhong Zhang, Wei Zhang, Fankai Lin, Yi-Xin Huo*. A novel protein purification strategy mediated by the combination of CipA and SspDnaBintein. J Biotechnol. 2019. 301: 97-104（发表当年影响因子2.563，发表年月2019-08）
[28] Yi-Xin Huo, Bo Zheng, Ning Wang, Yunpeng Yang, Xinxin Liang, Xiaoyan Ma*. Identifying amino acid overproducers using rare-codon-rich markers. J Vis Exp. 2019. 148: e59331（发表当年影响因子1.355，发表年月2019-06）
[27] Jiao Zhang, Fayu Yang, Yunpeng Yang, Yu Jiang, Yi-Xin Huo*. Optimizing a CRISPR-Cpf1-based genome engineering system for Corynebacterium glutamicum. Microb Cell Fact. 2019. 18(1): 1-13（发表当年影响因子6.352，发表年月2019-03）
[26] Huan Yu, Ning Wang, WenboHuo, Yuhong Zhang, Wei Zhang, Yu Yang, Zhenya Chen*, Yi-Xin Huo*. Establishment of BmoR-based biosensor to screen isobutanol overproducer. Microb Cell Fact. 2019. 18(1): 1-11（发表当年影响因子6.352，发表年月2019-02）
[25] Yuan Yu, Pengcheng Chang, Huan Yu, Huiyong Ren, Danning Hong, Zeyan Li, Ying Wang, Hao Song, Yi-Xin Huo, Chun Li*. Productive amyrin synthases for efficient α-amyrin synthesis in engineered Saccharomyces cerevisiae. ACS Synth Biol. 2018. 7(10): 2391-402（发表当年影响因子5.249，发表年月2018-10）
[24] Bo Zheng#, Xiaoyan Ma#, Ning Wang, Tingting Ding, Liwei Guo, Xiaorong Zhang, Yu Yang, Chun Li, Yi-Xin Huo*. Utilization of rare codon-rich markers for screening amino acid overproducers. Nat Commun. 2018. 9(1): 1-11（发表当年影响因子14.919，发表年月2018-09）
[23] Yi-Xin Huo, Huiyong Ren, Huan Yu, Luyao Zhao, Shengzhu Yu, Yajun Yan, Zhenya Chen*. CipA-mediating enzyme self-assembly to enhance the biosynthesis of pyrogallol in Escherichia coli. Appl Microbiol Biotechnol. 2018. 102(23): 10005-15（发表当年影响因子4.813，发表年月2018-09）
[22] 彭瑞婷，夏孟丽，茹家康，霍毅欣，杨宇*。聚氨酯塑料的微生物降解。生物工程学报。2018. 34(9): 1398-409（发表当年影响因子0.977，发表年月2018-09）
[21] Ke Xu#, Bo Lv#, Yi-Xin Huo*, Chun Li*. Toward the lowest energy consumption and emission in biofuel production: combination of ideal reactors and robust hosts. CurrOpinBiotechnol. 2018. 50: 19-24（发表当年影响因子9.74，发表年月2018-04）
[20] 杨发誉，杨云彭，霍毅欣*。合成生物学中不依赖限制性内切酶的分子克隆策略。中国生物化学与分子生物学报。2018. 34(4): 364-70（发表当年影响因子0.812，发表年月2018-04）
[19] Yi-Xin Huo, Liwei Guo, Xiaoyan Ma*. Biofuel production with a stress-resistant and growth phase-independent promoter: mechanism revealed by in vitro transcription assays. Appl Microbiol Biotechnol. 2018. 102(6): 2929-40（影响因子4.813，发表年月2018-02）
[18] Ming Zhu, Caixia Wang, Wentao Sun, Anqi Zhou, Ying Wang, Genlin Zhang, Xiaohong Zhou, Yi-Xin Huo, Chun Li*. Boosting 11-oxo-β-amyrin and glycyrrhetinic acid synthesis in Saccharomyces cerevisiae via pairing novel oxidation and reduction system from legume plants. Metab Eng. 2018. 45: 43-50（影响因子9.783，发表年月2018-01）
[17] Ke Xu, Liman Gao, Jalees Ul Hassan, Zhiping Zhao, Chun Li, Yi-Xin Huo, Guiyan Liu*. Improving the thermo-tolerance of yeast base on the antioxidant defense system. Chem Eng Sci. 2018. 175: 335-42（影响因子4.311，发表年月2018-01）
[16] Xiaoxue Wang, Dong Wang, Yi-Xin Huo, Dazhang Dai, Chihua Li, Chun Li, Guiyan Liu*. Identification of isoliquiritigenin as an activator that stimulates the enzymatic production of glycyrrhetinic acid monoglucuronide. Sci Rep-UK. 2017. 7(1): 1-10（影响因子4.38，发表年月2017-10）
[15] Yi-Xin Huo. Amino Acid Biosynthesis and Its Metabolic Engineering Applications. Engineering Microbial Metabolism for Chemical Synthesis. 2017: 69-95
[14] Xiaoyan Ma, Yi-Xin Huo*. The application of microfluidic-based technologies in the cycle of metabolic engineering. Syn Syst Biotechno. 2016. 1(3): 137-42（影响因子4.781，发表年月2016-09）
[13] Natasha K Vidangos, Johanna Heideker, Artem Lyubimov, MeindertLamers, Yi-Xin Huo, Jeffrey G Pelton, Jimmy Ton, Jay Gralla, James Berger, David E Wemmer*. DNA recognition by a σ54 transcriptional activator from Aquifexaeolicus. J Mol Biol. 2014. 426(21): 3553-68（影响因子5.469，发表年月2015-10）
[12] Yuan-Tao Zhang, Feng Jiang, Zhe-Xian Tian, Yi-Xin Huo, Yi-Cheng Sun, Yi-Ping Wang*. CRP-cyclic AMP dependent inhibition of the xylene-responsive σ54-promoter Pu in Escherichia coli. PLoS One. 2014. 9(1): e86727（影响因子3.24，发表年月2014-01）
[11] Yi-Xin Huo, David G Wernick, James C Liao*. Toward nitrogen neutral biofuel production. CurrOpinBiotechnol. 2012. 23(3): 406-13（影响因子9.74，发表年月2012-06）
[10] Han Li, Paul H Opgenorth, David G Wernick, Steve Rogers, Tung-Yun Wu, Wendy Higashide, Peter Malati, Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, James C Liao*. Integrated electromicrobial conversion of CO2 to higher alcohols. Science. 2012. 335(6076): 1596（影响因子47.728，发表年月2012-05）
[9] Harsharan Singh Bhatia, Rahul Agrawal, Sandeep Sharma, Yi-Xin Huo, Zhe Ying, Fernando Gomez-Pinilla*. Omega-3 fatty acid deficiency during brain maturation reduces neuronal and behavioral plasticity in adulthood. PloS one. 2011. 6(12): e28451（影响因子3.24，发表年月2011-12）
[8] Yi-Xin Huo, Kwang Myung Cho, Jimmy G Lafontaine Rivera, Emma Monte, Claire R Shen, Yajun Yan, James C Liao*. Conversion of proteins into biofuels by engineering nitrogen flux. Nat Biotechnol. 2011. 29(4): 346-51（影响因子54.908，发表年月2011-05）
[7] Yi-Xin Huo#, Yuan-Tao Zhang#, Yan Xiao, Xiaodong Zhang, Martin Buck, Annie Kolb, Yi-Ping Wang*. IHF-binding sites inhibit DNA loop formation and transcription initiation. Nucleic Acids Res. 2009. 37(12): 3878-86（影响因子16.971，发表年月2009-04）
[6] Jay D Gralla*, Yi-Xin Huo. Remodeling and activation of Escherichia coli RNA polymerase by osmolytes. Biochemistry. 2008. 47(50): 13189-96（影响因子3.163，发表年月2008-11）
[5] Yi‐Xin Huo, Adam Z Rosenthal, Jay D Gralla*. General stress response signalling: unwrapping transcription complexes by DNA relaxation via the sigma38 C‐terminal domain. Mol Microbiol. 2008. 70(2): 369-78（影响因子3.501，发表年月2008-09）
[4] Xian-Jun Mao#, Yi-Xin Huo#, Martin Buck, Annie Kolb, Yi-Ping Wang*. Interplay between CRP-cAMP and PII-Ntr systems forms novel regulatory network between carbon metabolism and nitrogen assimilation in Escherichia coli. Nucleic Acids Res. 2007. 35(5): 1432-40（影响因子16.971，发表年月2007-02）
[3] Yi-Xin Huo, Bei-Yan Nan, Cong-Hui You, Zhe-Xian Tian, Annie Kolb, Yi-Ping Wang*. FIS activates glnAp2 in Escherichia coli: role of a DNA bend centered at −55, upstream of the transcription start site. FEMS Microbiol Lett. 2006. 257(1): 99-105（影响因子2.742，发表年月2006-04）
[2] Yi‐Xin Huo#, Zhe‐Xian Tian#, Mathieu Rappas, Jin Wen, Yan‐Cheng Chen, Cong‐Hui You, Xiaodong Zhang, Martin Buck, Yi‐Ping Wang*, Annie Kolb. Protein‐induced DNA bending clarifies the architectural organization of the σ54‐dependent glnAp2 promoter. Mol Microbiol. 2006. 59(1): 168-80（影响因子3.501，发表年月2006-01）
[1] Yi‐Xin Huo. Activité de promoteurs dépendant de sigma54 et courbure de l'ADNinduite par des protéines/sous la direction de Yi-Ping Wang, Annie Kolb. 2005. Thèse soutenueen co-tutelle. - Thèse de doctorat: Microbiologie: Université de Pékin: 2005 Thèse de doctorat: Microbiologie: Paris 7: 2005
国际/国家专利
52. 霍毅欣，陈振娅，毋彤。一种对赤藓糖醇特异性响应的BmoR突变体生物传感器
51. 霍毅欣，陈振娅， 毋彤， 张然。对正戊醇绝对特异性响应的BmoR突变体及其应用
50. 霍毅欣，陈振娅，毋彤，张然。对异戊醇绝对特异性响应的BmoR突变体及其应用
49. 霍毅欣, 张然, 陈振娅, 毋彤。对正戊醇特异性响应的BmoR突变体及其应用
48. 霍毅欣, 陈振娅, 张然, 毋彤。对异戊醇特异性响应的BmoR突变体及其应用
47. 霍毅欣, 张然, 陈振娅, 毋彤, 王天鹏。一种对苯乙醇灵敏响应的BmoR突变体生物传感器
46. 孙丽超,霍毅欣, 范云娟, 郭淑元。一种香兰素生物传感器
45. 霍毅欣, 孙丽超, 范云娟, 郭丽微。一种异丁醛生物传感器及其应用
44. 霍毅欣, 马晓焉, 杨超, 李倚天。一株耐酸的Nissle 1917工程菌 CN118979002A
43. 霍毅欣, 马晓焉, 霍晨曦,晋李圆。一种提高菌株鲁棒性的抗酸胁迫元件CN118725056A
42. 霍毅欣, 马晓焉, 霍晨曦,晋李圆。一种提高菌株鲁棒性的耐盐胁迫元件 CN118702784A
41. 王雨涵, 侯真,霍毅欣, 陈振娅。一种高产异丁醇的WYH-1菌株 CN118703409A
40. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元。 System and method for screening functional mutants of sgRNA scaffold（一种筛选sgRNA 骨架活性突变体的系统及方法）
39. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元, 野昭晋。一种筛选 Cas9 蛋白突变体的系统及方法
38. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元。一种高通量筛选sgRNA骨架活性突变体的系统及方法 CN118497238A
37. 郭淑元, 孙丽超,霍毅欣, 夏燕, 董鹏宇。一种 O-甲基转移酶突变体及其在香兰素生产中的应用
36. 霍毅欣, 孙丽超, 梁泽宇, 郭淑元。一种筛选sgRNA骨架活性突变体的系统及方法 CN118853714A
35. 霍毅欣, 卢煜, 曹国强, 孙丽超, 梁泽宇。ENGINEERED MICROORGANISMS AND METHODS FOR BIOLOGICAL PRODUCTION OF AROMATIC AMINO ACID
34. 郭淑元, 孙丽超,霍毅欣, 夏燕,董鹏宇, 李佳维。一株高产香兰素的重组枯草芽胞杆菌及其应用
33. 郭淑元, 孙丽超,霍毅欣, 夏燕,董鹏宇, 韩钟娆。一株积累香兰素的枯草芽胞杆菌及其应用
32. 霍毅欣, 孙丽超, 郭淑元, 夏燕,董鹏宇, 李靖。一株耐受香兰素的枯草芽胞杆菌及其应用
31. 霍毅欣, 孙丽超, 郭淑元, 夏燕。一株耐受低pH和高浓度尿素的枯草芽胞杆菌 CN118620810A
30. 霍毅欣, 孙丽超, 郭淑元, 夏燕。一株pH和尿素耐受性提高的枯草芽胞杆菌CN117736949A
29. 霍毅欣, 定婷婷, 陈振娅。一株耐盐济州杆菌及其应用 CN119020189A
28. 金花,宋威, 刘少波,霍毅欣, 鲁言明,朴威兰。去除细胞器基因组污染序列的染色体组装方法及装置CN115261378A
27. 郑泽慧, 郭凯, 王庆玲, 田志喜,任宗明,霍毅欣, 刘书林, 黄艳华, 李哲, 郝永任。一株大豆根瘤菌及其应用CN114480171B 授权
26. 霍毅欣, 马晓焉, 郭昊, 孙丽超。一种适用于筛选高产天然氨基酸的菌株的方法CN116376946A
25. 霍毅欣, 马晓焉, 郭昊, 孙丽超。一种适用于筛选高产非蛋白质氨基酸的菌株的方法CN116376947A
24. 霍毅欣, 孙丽超, 郭丽微, 马晓焉。一种提升氨基酸胁迫条件下菌株性能的代谢工程方法CN116103325A
23. 霍毅欣, 孙丽超, 郭丽微, 马晓焉。一种筛选氨基酸高产菌株和氨基酸合成途径酶的方法CN116103361A
22. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。一种基于BmoR突变体的宽域生物传感器CN116023447A
21. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。对异丁醇特异性响应的BmoR突变体及其应用CN115991746A
20. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。一种基于BmoR突变体的高灵敏生物传感器CN115991747A
19. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。一种基于BmoR突变体的高敏感性的生物传感器CN115991748A
18. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。对正丁醇特异性响应的BmoR蛋白突变体及其应用CN115160415A 已授权
17. 霍毅欣, 陈振娅, 毋彤。对乙醇不敏感对正丁醇特异性响应的BmoR蛋白突变体CN115181168A已授权
16. 霍毅欣, 毋彤, 陈振娅, 张翠英。一种基于BmoR突变体的乙醇生产菌株的筛选方法。 CN115181167B 已授权
15. 陈振娅，霍毅欣，赵璐瑶。一种高效简便纯化蛋白的方法。CN 110714020 A
14.霍毅欣，陈振娅，赵璐瑶。一种高效简便的酶固定化的方法。CN 110563852 A
13.霍毅欣，马晓焉，马炼杰。一种实现生物燃料稳定生产的方法。CN 110551768
12. 霍毅欣，马晓焉，郭丽微。一种利用σ70非依赖型抗胁迫启动子实现异丁醛稳定高产的方法。CN 110551770 A
11. 霍毅欣，陈振娅，于盛竹。一种间苯三酚的生产方法。CN 110551769 A
10. 霍毅欣，黄潮勇。一种基于细菌内源同源重组系统的基因组编辑方法。CN 110669779 A
9.霍毅欣，郑博，王宁。一种利用稀有密码子在翻译水平调控基因表达的方法。CN 110592126 A
8. 杨宇，茹家康，霍毅欣。一种重组聚氨酯塑料降解酶的制备方法及应用。CN111172132 A
7.霍毅欣，王会艳，王宁。一种印楝素合成前体的底盘生产菌株WHY-60。CN 111944709 A
6.霍毅欣，王会艳，王宁。一种印楝素合成关键中间体的相关基因。CN111944797 A
5.Huo, Y.X., Schilling, B., and Rabizadeh, S. (2014) Improved carbon dioxide fixation via bypassing feedback regulation. WO application pending.
4.Huo, Y.X., Rohlin, L., and Rabizadeh, S. (2014) Microbial production of fuel components from low-molecular weight gas mixture. US9512450B1.
3.Huo, Y.X. and Cho. K.M. (2013) Two stage production of higher alcohols. WO 2014/028642.
2. Liao,J.C., Cho, K.M., Yan, Y and Huo, Y.X. (2011) Chemical production by recombinant microorganisms via fermentation of proteinacious biomass. WO 2012/061653.
1. Liao,J.C., Cho, K.M., Yan, Y and Huo, Y.X. (2011) Biofuel and chemical production by recombinant microorganisms via fermentation of proteinacious biomass. US9284566B2
主讲课程
1. 《分子生物学》本科生课程
2. 《生命科学基础》本科生和研究生课程
3. 《现代分子生物学》研究生课程
4. 《（英）现代生命科学与生物技术述评》研究生课程
5. 《绿色合成与智能制造研究生》研究生课程
主要教学成果
1. 《图解现代生物技术前沿》(ISBN : 978-7-5682-8031-0)，主编，北京理工大学出版社
2. 《生命科学基础》，副主编，负责6万字，高教出版社
3. 《合成生物学》，编委，负责1.6万字，化工出版社
4. 《Engineering Microbial Metabolism for Chemical Synthesis》，编者，负责1万字（总数7万字），World Scientific
5. 基于学科交叉实施生物科学通识教育教学模式改革（教改论文），2023，孙丽超，马晓焉，陈振娅，邹沁，霍毅欣，通讯作者，已录用
6. 基于读图的生物学专业能力考核改革与实践（教改论文），生物学杂志，2022. 39(06): p. 117-121，马晓焉, 陈振娅, 霍毅欣，通讯作者
7. 基于科学前沿的“一体式”微生物学开放实验课程探索（教改论文），生物学杂志，2022.39(03): p. 111-115，陈振娅，马晓焉，霍毅欣，通讯作者
8. 高站位与培养细节并重，精心培育研究生的创新能力，优秀教育教学成果奖，赵东旭，罗爱芹，霍毅欣，王丰，黄渊余
9. 北京理工大学第十三届青年教师教学基本功比赛，校级一等奖，孙丽超
10. 2020年北京市优秀本科毕业论文，优秀指导教师，霍毅欣
11. 2022年北京理工大学优秀硕士学位论文，优秀指导教师，霍毅欣
12. 2022年北京理工大学优秀博士学位论文，优秀指导教师，霍毅欣
13. 2022届北京理工大学本科生毕业设计（论文）重点项目，优秀指导教师，霍毅欣
14. 第七届北京市大学生生物学竞赛，北京市三等奖，霍毅欣
15. 第八届北京市大学生生物学竞赛，北京市三等奖，霍毅欣
16. 第九届北京市大学生生物学竞赛，北京市三等奖，霍毅欣，孙丽超
17. “青创北京”2023年“挑战杯”首都大学生课外学术科技作品竞赛“黑科技”专项赛，北京市一等奖，霍毅欣，孙丽超，陈振娅
18. 中国国际大学生创新大赛(2024)，北京赛区三等奖，霍毅欣，陈振娅，孙丽超，邹沁，马晓焉
19. “青创北京”2024年“挑战杯”首都大学生创业计划竞赛，北京市金奖，霍毅欣，陈振娅，孙丽超，邹沁，马晓焉
20. 第十四届“挑战杯”秦创原中国大学生创业计划竞赛（2024年），全国金奖，指导教师：霍毅欣，陈振娅，孙丽超，邹沁，马晓焉
21. 生命科学基础课群，获批聚能课程，霍毅欣等人
22. 延根赓续、自力更“生” ——大国博弈背景下的我国生物学创新人才培养实践，获北京理工大学教育教学成果二等奖，霍毅欣等人